Hon.-Prof. Dr. Helmut Grubmüller

1-324 of 324
 
The bibliographical data in your publication list are complete
You can correct existing data in the blue highlighted fields.To do this, please click on the coloured field. It is not possible to delete data here.
Fields that are not marked in colour (e. g. the authors) can be edited using the input form. To do so, click on the in front of the respective publication.
The bibliographic data in your publication list may be incomplete. You can
  • add any missing data in the fields marked in red or
  • correct existing data in the blue highlighted fields.
To do this, please click on the coloured field. It is not possible to delete data here.
Fields that are not marked in colour (e. g. the authors) can be edited using the input form. To do so, click on the in front of the respective publication.
Check/Uncheck all
  • 2024 | Preprint
    ​ ​Bayesian electron density determination from sparse and noisy single-molecule X-ray scattering images​
    Schultze, S.& Grubmüller, H. ​ (2024)
    ​Details  arXiv 
  • 2024 | Preprint
    ​ ​Stochastic Algorithms for Large-Scale Composite Optimization: the Case of Single-Shot X-FEL Imaging​
    Luke, D. R. ; Schultze, S.& Grubmüller, H. ​ (2024)
    ​Details  arXiv 
  • 2024 | Journal Article | Overview
    ​ ​Single-particle Cryo-EM and molecular dynamics simulations: A perfect match​
    Bock, L. V. ; Igaev, M. & Grubmüller, H. ​ (2024) 
    Current Opinion in Structural Biology, 86 art. 102825​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.sbi.2024.102825 
    ​Details  DOI 
  • 2023 | Preprint
    ​ ​De novo structural ensemble determination from single-molecule X-ray scattering: A Bayesian approach​
    Schultze, S.& Grubmüller, H. ​ (2023). DOI: https://doi.org/10.48550/arXiv.2302.09136 
    ​Details  DOI  arXiv 
  • 2023 | Journal Article
    ​ ​Discrimination between cyclic nucleotides in a cyclic nucleotide-gated ion channel​
    Pan, Y.; Pohjolainen, E.; Schmidpeter, P. A. M.; Vaiana, A. C.; Nimigean, C. M.; Grubmüller, H.   & Scheuring, S.​ (2023) 
    Nature Structural & Molecular Biology,.​ DOI: https://doi.org/10.1038/s41594-023-00955-3 
    ​Details  DOI 
  • 2022 | Preprint
    ​ ​Effects of cryo-EM cooling on structural ensembles​
    Bock, L. V.& Grubmüller, H. ​ (2022). DOI: https://doi.org/10.1101/2021.10.08.463658 
    ​Details  DOI 
  • 2022 | Journal Article
    ​ ​GROMACS in the Cloud: A Global Supercomputer to Speed Up Alchemical Drug Design​
    Kutzner, C.; Kniep, C.; Cherian, A.; Nordstrom, L.; Grubmüller, H. ; de Groot, B. L.   & Gapsys, V.​ (2022) 
    Journal of Chemical Information and Modeling, art. acs.jcim.2c00044​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00044 
    ​Details  DOI 
  • 2022 | Journal Article
    ​ ​Bending-torsional elasticity and energetics of the plus-end microtubule tip​
    Igaev, M. & Grubmüller, H. ​ (2022) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences, 119(12).​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2115516119 
    ​Details  DOI 
  • 2022 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Folding of VemP into translation-arresting secondary structure is driven by the ribosome exit tunnel​
    Kolář, M. H.; Nagy, G.; Kunkel, J.; Vaiana, S. M.; Bock, L. V.   & Grubmüller, H. ​ (2022) 
    Nucleic Acids Research, 50(4) pp. 2258​-2269​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkac038 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2022 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Effects of cryo-EM cooling on structural ensembles​
    Bock, L. V.   & Grubmüller, H. ​ (2022) 
    Nature Communications, 13(1) art. 1709​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-022-29332-2 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2021 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Time-Lagged Independent Component Analysis of Random Walks and Protein Dynamics​
    Schultze, S. & Grubmüller, H. ​ (2021) 
    Journal of chemical theory and computation, 17(9) pp. 5766​-5776​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.1c00273 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2021 | Journal Article | 
    ​ ​A CUDA fast multipole method with highly efficient M2L far field evaluation​
    Kohnke, B.; Kutzner, C.; Beckmann, A.; Lube, G. ; Kabadshow, I.; Dachsel, H. & Grubmüller, H. ​ (2021) 
    The International Journal of High Performance Computing Applications, 35(1) pp. 97​-117​.​ DOI: https://doi.org/10.1177/1094342020964857 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Preprint
    ​ ​Folding of VemP into translation-arresting secondary structure is driven by the ribosome exit tunnel​
    Kolář, M. H.; Nagy, G.; Kunkel, J.; Vaiana, S. M.; Bock, L. V.& Grubmüller, H. ​ (2021). DOI: https://doi.org/10.1101/2021.04.15.440051 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Journal Article
    ​ ​Small-sample limit of the Bennett acceptance ratio method and the variationally derived intermediates​
    Reinhardt, M. & Grubmüller, H. ​ (2021) 
    Physical Review E, 104(5) art. 054133​.​ DOI: https://doi.org/10.1103/PhysRevE.104.054133 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Journal Article
    ​ ​ATP–Magnesium Coordination: Protein Structure-Based Force Field Evaluation and Corrections​
    Buelens, F. P.; Leonov, H.; de Groot, B. L.   & Grubmüller, H. ​ (2021) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 17(3) pp. 1922​-1930​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c01205 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Journal Article
    ​ ​Per​
    Heinz, L. P. & Grubmüller, H. ​ (2021) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 17(4) pp. 2090​-2098​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00961 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Journal Article
    ​ ​Implementation of a Bayesian secondary structure estimation method for the SESCA circular dichroism analysis package​
    Nagy, G. & Grubmüller, H. ​ (2021) 
    Computer Physics Communications, 266 art. S001046552100134X​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2021.108022 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Journal Article
    ​ ​GROMACS implementation of free energy calculations with non-pairwise Variationally derived Intermediates​
    Reinhardt, M. & Grubmüller, H. ​ (2021) 
    Computer Physics Communications, 264 art. S0010465521000631​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2021.107931 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Journal Article
    ​ ​Choice of fluorophore affects dynamic DNA nanostructures​
    Jahnke, K.; Grubmüller, H. ; Igaev, M. & Göpfrich, K.​ (2021) 
    Nucleic Acids Research, 49(7) pp. 4186​-4195​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab201 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Journal Article
    ​ ​Spatially resolved free-energy contributions of native fold and molten-globule-like Crambin​
    Heinz, L. P. & Grubmüller, H. ​ (2021) 
    Biophysical Journal, 120(16) pp. 3470​-3482​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2021.05.019 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Structural and mechanistic basis for translation inhibition by macrolide and ketolide antibiotics​
    Beckert, B.; Leroy, E. C.; Sothiselvam, S.; Bock, L. V. ; Svetlov, M. S.; Graf, M. & Arenz, S. et al.​ (2021) 
    Nature Communications, 12(1) pp. 4466​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-24674-9 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2020 | Journal Article | Erratum
    ​ ​Correction to “Probing the Accuracy of Explicit Solvent Constant pH Molecular Dynamics Simulations for Peptides”​
    Dobrev, P.; Vemulapalli, S. P. B.; Nath, N. ; Griesinger, C. ; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 16(7) pp. 4753​-4753​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00500 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article
    ​ ​A GPU-Accelerated Fast Multipole Method for GROMACS: Performance and Accuracy​
    Kohnke, B.; Kutzner, C. & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 16(11) pp. 6938​-6949​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00744 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article
    ​ ​Determining Free-Energy Differences Through Variationally Derived Intermediates​
    Reinhardt, M. & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 16(6) pp. 3504​-3512​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00106 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article
    ​ ​Sequential Water and Headgroup Merger: Membrane Poration Paths and Energetics from MD Simulations​
    Bubnis, G. & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    Biophysical Journal, 119(12) pp. 2418​-2430​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2020.10.037 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article
    ​ ​tRNA Dissociation from EF-Tu after GTP Hydrolysis: Primary Steps and Antibiotic Inhibition​
    Warias, M.; Grubmüller, H.   & Bock, L. V. ​ (2020) 
    Biophysical Journal, 118(1) pp. 151​-161​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2019.10.028 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article | 
    ​ ​How proteins open fusion pores: insights from molecular simulations​
    Risselada, H. J.   & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    European Biophysics Journal,.​ DOI: https://doi.org/10.1007/s00249-020-01484-3 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article
    ​ ​Microtubule instability driven by longitudinal and lateral strain propagation​
    Igaev, M. & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    PLoS Computational Biology, 16(9) pp. e1008132​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008132 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article | 
    ​ ​How accurate is circular dichroism-based model validation?​
    Nagy, G. & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    European Biophysics Journal, 49(6) pp. 497​-510​.​ DOI: https://doi.org/10.1007/s00249-020-01457-6 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Book Chapter
    ​ ​Single Particle Imaging with FEL Using Photon Correlations​
    von Ardenne, B.& Grubmüller, H. ​ (2020)
    In:​Salditt, Tim; Egner, Alexander; Luke, D. Russell​ (Eds.), Nanoscale Photonic Imaging pp. 435​-455. (Vol. 134). ​Cham: ​Springer International Publishing. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-030-34413-9_16 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article
    ​ ​Probing the Accuracy of Explicit Solvent Constant pH Molecular Dynamics Simulations for Peptides​
    Dobrev, P.; Vemulapalli, S. P. B.; Nath, N. ; Griesinger, C.   & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 16(4) pp. 2561​-2569​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.9b01232 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Journal Article
    ​ ​Variationally derived intermediates for correlated free-energy estimates between intermediate states​
    Reinhardt, M. & Grubmüller, H. ​ (2020) 
    Physical Review. E, 102(4).​ DOI: https://doi.org/10.1103/PhysRevE.102.043312 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Book Chapter
    ​ ​GROMEX: A Scalable and Versatile Fast Multipole Method for Biomolecular Simulation​
    Kohnke, B.; Ullmann, T. R.; Beckmann, A.; Kabadshow, I.; Haensel, D.; Morgenstern, L.& Dobrev, P. et al.​ (2020)
    In:​Bungartz, Hans-Joachim; Reiz, Severin; Uekermann, Benjamin; Neumann, Philipp; Nagel, Wolfgang E.​ (Eds.), Software for Exascale Computing - SPPEXA 2016-2019 pp. 517​-543. ​Cham: ​Springer. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-030-47956-5_17 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Preprint
    ​ ​Choice of fluorophore affects dynamic DNA nanostructures​
    Jahnke, K.; Grubmüller, H. ; Igaev, M.& Göpfrich, K.​ (2020). DOI: https://doi.org/10.1101/2020.12.12.422444 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Sharing Data from Molecular Simulations​
    Abraham, M.; Apostolov, R.; Barnoud, J.; Bauer, P.; Blau, C. ; Bonvin, A. M. J. J. & Chavent, M. et al.​ (2019) 
    Journal of Chemical Information and Modeling, 59(10) pp. 4093-4099​-4099​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00665 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2019 | Journal Article
    ​ ​SESCA: Predicting Circular Dichroism Spectra from Protein Molecular Structures​
    Nagy, G.; Igaev, M.; Jones, N. C.; Hoffmann, S. V. & Grubmüller, H. ​ (2019) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 15(9) pp. 5087​-5102​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.9b00203 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Journal Article
    ​ ​More bang for your buck: Improved use of GPU nodes for GROMACS 2018​
    Kutzner, C.; Páll, S.; Fechner, M.; Esztermann, A.; de Groot, B. L.   & Grubmüller, H. ​ (2019) 
    Journal of Computational Chemistry, 40(27) pp. 2418​-2431​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.26011 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Journal Article | 
    ​ ​Thermodynamic control of −1 programmed ribosomal frameshifting​
    Bock, L. V. ; Caliskan, N. ; Korniy, N.; Peske, F. ; Rodnina, M. V.   & Grubmüller, H. ​ (2019) 
    Nature Communications, 10(1).​ DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-019-12648-x 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Journal Article
    ​ ​Thermodynamic Control of Ribosomal Frameshifting​
    Bock, L. V.; Caliskan, N.; Korniy, N.; Peske, F.; Rodnina, M. V.   & Grubmüller, H. ​ (2019) 
    Biophysical Journal, 116(3) pp. 361a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2018.11.1966 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Journal Article
    ​ ​Computing Spatially Resolved Rotational Hydration Entropies from Atomistic Simulations​
    Heinz, L. P. & Grubmüller, H. ​ (2019) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 16(1) pp. 108​-118​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.9b00926 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Journal Article | 
    ​ ​Automated cryo-EM structure refinement using correlation-driven molecular dynamics​
    Igaev, M.; Kutzner, C.; Bock, L. V. ; Vaiana, A. C.   & Grubmüller, H. ​ (2019) 
    eLife, 8.​ DOI: https://doi.org/10.7554/eLife.43542 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Journal Article
    ​ ​Heterogeneous and rate-dependent streptavidin–biotin unbinding revealed by high-speed force spectroscopy and atomistic simulations​
    Rico, F.; Russek, A.; González, L.; Grubmüller, H.   & Scheuring, S.​ (2019) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 116(14) pp. 6594​-6601​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.1816909116 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Journal Article
    ​ ​Active role of elongation factor G in maintaining the mRNA reading frame during translation​
    Peng, B.-Z.; Bock, L. V. ; Belardinelli, R. ; Peske, F. ; Grubmüller, H.   & Rodnina, M. V. ​ (2019) 
    Science Advances, 5(12) pp. eaax8030​.​ DOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.aax8030 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2018 | Journal Article
    ​ ​Transient Secondary and Tertiary Structure Formation Kinetics in the Intrinsically Disordered State of α-Synuclein from Atomistic Simulations​
    Graen, T.; Klement, R.; Grupi, A.; Haas, E. & Grubmüller, H. ​ (2018) 
    ChemPhysChem, 19(19) pp. 2507​-2511​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/cphc.201800504 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Journal Article
    ​ ​Directing Membrane Poration in MD Simulations with Embedded Mechanical Gizmos​
    Bubnis, G. & Grubmüller, H. ​ (2018) 
    Biophysical Journal, 114(3) pp. 674a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2017.11.3636 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Journal Article
    ​ ​Calculation of Absolute Solvation Shell Entropies from MD Trajectories via Permutation Reduction​
    Heinz, L. P. & Grubmüller, H. ​ (2018) 
    Biophysical Journal, 114(3) pp. 677a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2017.11.3652 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Journal Article
    ​ ​Nucleotide-dependent Conformational Dynamics and Energetics of Tubulin​
    Igaev, M. & Grubmüller, H. ​ (2018) 
    Biophysical Journal, 114(3) pp. 504a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2017.11.2754 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Journal Article
    ​ ​Effects of cryo-EM Freezing on the Structural Ensemble​
    Bock, L. V.   & Grubmüller, H. ​ (2018) 
    Biophysical Journal, 114(3) pp. 160a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2017.11.897 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Journal Article | 
    ​ ​The 2018 biomembrane curvature and remodeling roadmap​
    Bassereau, P.; Jin, R.; Baumgart, T.; Deserno, M.; Dimova, R.; Frolov, V. A & Bashkirov, P. V et al.​ (2018) 
    Journal of Physics. D, Applied Physics, 51(34) pp. 343001​.​ DOI: https://doi.org/10.1088/1361-6463/aacb98 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Journal Article
    ​ ​ATP as a Fuel Molecule: Evolutionary Selection of Magnesium-ATP Interaction Mode Facilitates Lossless Chemomechanical Coupling for ATPases​
    Buelens, F. P.; Leonov, H.; de Groot, B. L.   & Grubmüller, H. ​ (2018) 
    Biophysical Journal, 114(3) pp. 680a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2017.11.3668 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Journal Article | 
    ​ ​Structure determination from single molecule X-ray scattering with three photons per image​
    von Ardenne, B.; Mechelke, M. & Grubmüller, H. ​ (2018) 
    Nature Communications, 9(1).​ DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-018-04830-4 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Journal Article | 
    ​ ​Microtubule assembly governed by tubulin allosteric gain in flexibility and lattice induced fit​
    Igaev, M. & Grubmüller, H. ​ (2018) 
    eLife, 7.​ DOI: https://doi.org/10.7554/eLife.34353 
    ​Details  DOI 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​Molecular simulations of the ribosome and associated translation factors​
    Bock, L. V. ; Grubmüller, H.   & Kolář, M. H.​ (2017) 
    Current opinion in structural biology, 49 pp. 27​-35​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.sbi.2017.11.003 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​Structural Basis for Polyproline-Mediated Ribosome Stalling and Rescue by the Translation Elongation Factor EF-P​
    Huter, P.; Arenz, S.; Bock, L. V. ; Graf, M.; Frister, J. O.; Heuer, A. & Peil, L. et al.​ (2017) 
    Molecular cell, 68(3) pp. 515.e6​-527.e6​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.molcel.2017.10.014 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2017 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Cationic and Anionic Impact on the Electronic Structure of Liquid Water​
    Yin, Z.; Inhester, L.; Thekku Veedu, S.; Quevedo, W.; Pietzsch, A.; Wernet, P. & Groenhof, G.  et al.​ (2017) 
    The journal of physical chemistry letters, 8(16) pp. 3759​-3764​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.7b01392 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​Engineering fatty acid synthases for directed polyketide production​
    Gajewski, J.; Buelens, F.; Serdjukow, S.; Janßen, M.; Cortina, N.; Grubmüller, H.   & Grininger, M.​ (2017) 
    Nature chemical biology, 13(4) pp. 363​-365​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nchembio.2314 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​Mechanochemical Energy Transduction during the Main Rotary Step in the Synthesis Cycle of F1-ATPase​
    Czub, J.; Wieczór, M.; Prokopowicz, B. & Grubmüller, H. ​ (2017) 
    Journal of the American Chemical Society, 139(11) pp. 4025​-4034​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/jacs.6b11708 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​Ions in Action - Studying Ion Channels by Computational Electrophysiology in GROMACS​
    Kutzner, C.; Ullmann, R. T.; de Groot, B. L. ; Zachariae, U. & Grubmüller, H. ​ (2017) 
    Biophysical Journal, 112(3) pp. 139a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2016.11.769 
    ​Details  DOI 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​CHARMM36: An Improved Force Field for Folded and Intrinsically Disordered Proteins​
    Huang, J.; Rauscher, S.; Nawrocki, G.; Ran, T.; Feig, M.; de Groot, B. L.   & Grubmüller, H.  et al.​ (2017) 
    Biophysical Journal, 112(3) pp. 175a​-176a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2016.11.971 
    ​Details  DOI 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​Gromex: Electrostatics with Chemical Variability for Realistic Molecular Simulations on the Exascale​
    Ullmann, R. T.; Kutzner, C.; Beckmann, A.; Kohnke, B.; Haensel, D.; Kabadshow, I. & Dachsel, H. et al.​ (2017) 
    Biophysical Journal, 112(3) pp. 176a​-177a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2016.11.976 
    ​Details  DOI 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​Dynamics and Energetics of Elongation Factor SelB in the Ternary Complex and the Ribosome​
    Bock, L. V. ; Fischer, N. ; Stark, H.   & Grubmüller, H. ​ (2017) 
    Biophysical Journal, 112(3) pp. 49a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2016.11.302 
    ​Details  DOI 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​A Flexible, GPU - Powered Fast Multipole Method for Realistic Biomolecular Simulations in Gromacs​
    Kohnke, B.; Ullmann, R. T.; Kutzner, C.; Beckmann, A.; Haensel, D.; Kabadshow, I. & Dachsel, H. et al.​ (2017) 
    Biophysical Journal, 112(3) pp. 448a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2016.11.2402 
    ​Details  DOI 
  • 2017 | Journal Article
    ​ ​Accurate Three States Model for Amino Acids with Two Chemically Coupled Titrating Sites in Explicit Solvent Atomistic Constant pH Simulations and pK(a) Calculations​
    Dobrev, P.; Donnini, S.; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2017) 
    Journal of chemical theory and computation, 13(1) pp. 147​-160​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.6b00807 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​A Quantitative Model for cAMP Binding to the Binding Domain of MloK1​
    Voss, B.; Seifert, R.; Kaupp, U. B. & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Biophysical Journal, 111(8) pp. 1668​-1678​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2016.09.014 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2016 | Journal Article | 
    ​ ​A combined cryo-EM and molecular dynamics approach reveals the mechanism of ErmBL-mediated translation arrest​
    Arenz, S.; Bock, L. V. ; Graf, M.; Innis, C. A.; Beckmann, R.; Grubmüller, H.   & Vaiana, A. C.  et al.​ (2016) 
    Nature communications, 7 art. 12026​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/ncomms12026 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Charge-Neutral Constant pH Molecular Dynamics Simulations Using a Parsimonious Proton Buffer​
    Donnini, S.; Ullmann, R. T.; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 12(3) pp. 1040​-1051​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.5b01160 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Phi29 Connector-DNA Interactions Govern DNA Crunching and Rotation, Supporting the Check-Valve Model​
    Kumar, R. & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(2) pp. 455​-469​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.12.010 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2016 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​BASDet: Bayesian approach(es) for structure determination from single molecule X-ray diffraction images​
    Walczak, M. & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Computer Physics Communications, 201 pp. 159​-166​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2015.12.014 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Molecular Dynamics Simulations of Alpha-Synuclein Ensemble FRET Measurements from Different Force Fields​
    Klement, R.; Graen, T.; Grupi, A.; Haas, E. & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(3) pp. 551a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.2949 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Atomistic and Reaction-Kinetic Modelling for Engineering of Fatty Acid Synthase​
    Buelens, F. & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(3) pp. 318a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.1705 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Directing Membrane Pore and Stalk Formation in MD Simulations with Embedded Mechanical Devices​
    Bubnis, G. & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(3) pp. 570a​-571a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.3053 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​CHARMM36m: an improved force field for folded and intrinsically disordered proteins​
    Huang, J.; Rauscher, S.; Nawrocki, G.; Ran, T.; Feig, M.; Groot, B. L. de   & Grubmüller, H.  et al.​ (2016) 
    Nature Methods, 14(1) pp. 71​-73​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nmeth.4067 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Structural Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins Depend Strongly on Force Field: A Comparison to Experiment​
    Rauscher, S.; Gapsys, V. ; Zhou, M.; Van, Q. ; Gajda, M.; Zweckstetter, M.   & Enderlein, J.  et al.​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(3) pp. 358a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.1932 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​From CRYO-EM Densities to Atom Coordinates and Ensembles with Bayes Approach​
    Blau, C. ; Lenner, N.; Kutzner, C.; Grubmüller, H.   & Lindahl, E.​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(3) pp. 156a​-157a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.878 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​NuSol: Numerical solver for the 3D stationary nuclear Schrödinger equation​
    Graen, T. & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Computer Physics Communications, 198 pp. 169​-178​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2015.08.023 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Low Energy Barriers and a Dynamic Contact Network between Ribosomal Subunits Enable Rapid tRNA Translocation​
    Bock, L. V. ; Blau, C. ; Vaiana, A. C.   & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(3) pp. 3a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.061 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​ErmBL Translation on the Ribosome in the Presence of Erythromycin is Stalled by Inhibition of Peptide Bond Formation​
    Bock, L. V. ; Arenz, S.; Wilson, D. N.; Grubmüller, H.   & Vaiana, A. C. ​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(3) pp. 234a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.1291 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Estimating the Ruggedness of Protein Free Energy Landscapes from Molecular Dynamics Simulations​
    Volkhardt, A. & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Biophysical Journal, 110(3) pp. 643a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.3440 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article | Erratum
    ​ ​Corrigendum: g_membed: Efficient insertion of a membrane protein into an equilibrated lipid bilayer with minimal perturbation​
    Wolf, M. G.; Hoefling, M.; Aponte-Santamaría, C.; Grubmüller, H.   & Groenhof, G. ​ (2016) 
    Journal of Computational Chemistry, 37(21) pp. 2038​-2038​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.24386 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​The Low Barrier Hydrogen Bond in the Photoactive Yellow Protein: A Vacuum Artifact Absent in the Crystal and Solution​
    Graen, T.; Inhester, L.; Clemens, M.; Grubmüller, H.   & Groenhof, G. ​ (2016) 
    Journal of the American Chemical Society, 138(51) pp. 16620​-16631​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/jacs.6b05609 
    ​Details  DOI 
  • 2016 | Journal Article
    ​ ​Exploiting Lipid Permutation Symmetry to Compute Membrane Remodeling Free Energies​
    Bubnis, G.; Risselada, H. J.   & Grubmüller, H. ​ (2016) 
    Physical Review Letters, 117(18) art. 188102​.​ DOI: https://doi.org/10.1103/PhysRevLett.117.188102 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2016 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​The pathway to GTPase activation of elongation factor SelB on the ribosome​
    Fischer, N. ; Neumann, P. ; Bock, L. V. ; Maracci, C. ; Wang, Z.; Paleskava, A.   & Konevega, A. L.  et al.​ (2016) 
    Nature, 540(7631) pp. 80​-85​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nature20560 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Dynamic contact network between ribosomal subunits enables rapid large-scale rotation during spontaneous translocation​
    Bock, L. V. ; Blau, C. ; Vaiana, A. C.   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Nucleic Acids Research, 43(14) pp. 6747​-6760​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkv649 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​do_x3dna: a tool to analyze structural fluctuations of dsDNA or dsRNA from molecular dynamics simulations​
    Kumar, R. & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Bioinformatics, 31(15) pp. 2583​-2585​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv190 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Bringing Force Probe Molecular Dynamics Simulations Closer to Experiments​
    Russek, A.; Rico, F.; Scheuring, S. & Grubmueller, H. ​ (2015) 
    Biophysical Journal, 108(2) art. 166a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.11.918 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Charge separation and isolation in strong water droplet impacts​
    Wiederschein, F. ; Vöhringer-Martinez, E.; Beinsen, A.; Postberg, F.; Schmidt, J. ; Srama, R. & Stolz, F. et al.​ (2015) 
    Physical Chemistry Chemical Physics, 17(10) pp. 6858​-6864​.​ DOI: https://doi.org/10.1039/C4CP05618C 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Lipid Binding Defects and Perturbed Synaptogenic Activity of a Collybistin R290H Mutant That Causes Epilepsy and Intellectual Disability​
    Papadopoulos, T. ; Schemm, R.; Grubmüller, H.   & Brose, N. ​ (2015) 
    Journal of Biological Chemistry, 290(13) pp. 8256​-8270​.​ DOI: https://doi.org/10.1074/jbc.M114.633024 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Conformational Dynamics and Functional Asymmetry of ABCE1, a Ribosome Recycling Protein​
    Leonov, H.; de Groot, B. L.   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Biophysical Journal, 108(2) pp. 512a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.11.2806 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Structural Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins using Molecular Dynamics Simulation​
    Rauscher, S.; Gapsys, V. ; de Groot, B. L.   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Biophysical Journal, 108(2) pp. 14a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.11.100 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Balanced Interactions between Ribosomal Subunits Allow Rapid Large-Scale Rotation​
    Bock, L. V. ; Blau, C. ; Vaiana, A. C.   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Biophysical Journal, 108(2) pp. 26a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.11.168 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Structural Determinants of Hybrid State Intermediates of the Bacterial Ribosome​
    Vaiana, A. C. ; Kutzner, C.; Bock, L. V. ; Blau, C.   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Biophysical Journal, 108(2) pp. 318a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.11.1730 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Bayesian cryo-EM Refinement​
    Blau, C. ; Bock, L. ; Kutzner, C.; Vaiana, A.   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Biophysical Journal, 108(2) pp. 470a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.11.2571 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Understanding Thermodynamics of Conformational Change in the F-ATPase​
    Leioatts, N. & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Biophysical Journal, 108(2) pp. 58a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.11.350 
    ​Details  DOI 
  • 2015 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​TatBC-Independent TatA/Tat Substrate Interactions Contribute to Transport Efficiency​
    Taubert, J.; Hou, B.; Risselada, H. J. ; Mehner, D.; Luensdorf, H.; Grubmüller, H.   & Brueser, T.​ (2015) 
    PLoS ONE, 10(3) art. e0119761​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0119761 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Journal Article
    ​ ​Role of Structural Dynamics at the Receptor G Protein Interface for Signal Transduction​
    Rose, A. S; Zachariae, U.; Grubmüller, H. ; Hofmann, K. P.; Scheerer, P. & Hildebrand, P. W.​ (2015) 
    PLoS ONE, 10(11).​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0143399 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2015 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Best bang for your buck: GPU nodes for GROMACS biomolecular simulations​
    Kutzner, C.; Pall, S.; Fechner, M.; Esztermann, A.; Groot, B. L. de   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Journal of Computational Chemistry, 36(26) pp. 1990​-2008​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.24030 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Journal Article | 
    ​ ​Hydrophobic mismatch sorts SNARE proteins into distinct membrane domains​
    Milovanovic, D. ; Honigmann, A.; Koike, S. ; Göttfert, F. ; Pähler, G.; Junius, M.   & Müllar, S. et al.​ (2015) 
    Nature Communications, 6 art. 5984​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/ncomms6984 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Binding Affinities Controlled by Shifting Conformational Equilibria: Opportunities and Limitations​
    Michielssens, S.; Groot, B. L. de   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Biophysical Journal, 108(10) pp. 2585​-2590​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.04.012 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​PspF‐binding domain PspA1–144 and the PspA·F complex: New insights into the coiled–coil‐dependent regulation of AAA+ proteins​
    Osadnik, H.; Schoepfel, M.; Heidrich, E.; Mehner, D.; Lilie, H.; Parthier, C. & Risselada, H. J.  et al.​ (2015) 
    Molecular Microbiology, 98(4) pp. 743​-759​.​ DOI: https://doi.org/10.1111/mmi.13154 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Structural Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins Depend Strongly on Force Field: A Comparison to Experiment​
    Rauscher, S.; Gapsys, V. ; Gajda, M. J.; Zweckstetter, M. ; Groot, B. L. de   & Grubmüller, H. ​ (2015) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 11(11) pp. 5513​-5524​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.5b00736 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​MD Simulations and FRET Reveal an Environment: Sensitive Conformational Plasticity of Importin-beta​
    Halder, K.; Doelker, N.; Van, Q. ; Gregor, I. ; Dickmanns, A. ; Baade, I.   & Kehlenbach, R. H.  et al.​ (2015) 
    Biophysical Journal, 109(2) pp. 277​-286​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.06.014 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Conformational Dynamics During GPCR - G Protein Coupling​
    Rose, A. S.; Elgeti, M.; Scheerer, P.; Zacchariae, U.; Heck, M.; Bartl, F. J. & Grubmüller, H.  et al.​ (2014) 
    Biophysical Journal, 106(2) pp. 37a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.11.282 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Position of Transmembrane Helix 6 Determines Receptor G Protein Coupling Specificity​
    Rose, A.; Elgeti, M.; Zachariae, U.; Grubmüller, H. ; Hofmann, K. P.; Scheerer, P. & Hildebrand, P. W.​ (2014) 
    Journal of the American Chemical Society, 136(32) pp. 11244​-11247​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ja5055109 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​AMBER-DYES: Characterization of Charge Fluctuations and Force Field Parameterization of Fluorescent Dyes for Molecular Dynamics Simulations​
    Graen, T.; Hoefling, M. & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 10(12) pp. 5505​-5512​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ct500869p 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Elastic Properties and Heterogeneous Stiffness of the Phi29 Motor Connector Channel​
    Kumar, R. & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Biophysical Journal, 106(6) pp. 1338​-1348​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.01.028 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Anomalous Surface Diffusion of Protons on Lipid Membranes​
    Wolf, M.; Grubmüller, H.   & Groenhof, G. ​ (2014) 
    Biophysical Journal, 107(1) pp. 76​-87​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.04.062 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Bayesian orientation estimate and structure information from sparse single-molecule x-ray diffraction images​
    Walczak, M. & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Physical Review E, 90(2) art. 022714​.​ DOI: https://doi.org/10.1103/PhysRevE.90.022714 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Rotation Triggers Nucleotide-Independent Conformational Transition of the Empty β Subunit of F1-ATPase​
    Czub, J. & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Journal of the American Chemical Society, 136(19) pp. 6960​-6968​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ja500120m 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article | Erratum
    ​ ​Erratum: “Core hole screening and decay rates of double core ionized first row hydrides” [J. Chem. Phys. 138, 164304 (2013)]​
    Inhester, L.; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    The Journal of Chemical Physics, 141(6) art. 069902​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.4892983 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Book Chapter
    ​ ​Scaling of the GROMACS 4.6 molecular dynamics code on SuperMUC​
    Kutzner, C.; Apostolov, R.; Hess, B.& Grubmüller, H. ​ (2014)
    In:​Bader, M.; Bode, A.; Bungartz, H.-J.; Gerndt, M.; Joubert, G.R.; Peters, F.​ (Eds.), Parallel Computing: Accelerating Computational Science and Engineering Cse pp. 722​-730. ​US: ​IOS Press.
    ​Details 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Concerted Interactions between Ribosomal Subunits Allow for Large-Scale Rotations​
    Bock, L. V. ; Blau, C. ; Vaiana, A. C.   & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Biophysical Journal, 106(2) pp. 491a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.11.2748 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Exceptional Heterogeneous Elasticity and One-Way Valve Mechanism of the PHi29 Head-Tail Connector​
    Kumar, R. & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Biophysical Journal, 106(2) pp. 60a​-61a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.11.414 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Lifting Constraints in Protein Molecular Dynamics Simulations​
    Graen, T. & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Biophysical Journal, 106(2) pp. 405a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.11.2284 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article
    ​ ​Refining Crystal Structures Against Cryo-EM Data using Molecular Dynamics Simulations to Obtain a Complete Atomistic Pathway of Transfer RNA Translocation​
    Vaiana, A. C. ; Kutzner, C.; Bock, L. V. ; Blau, C.   & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Biophysical Journal, 106(2) pp. 240a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.11.1405 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Conference Abstract
    ​ ​Rapid and Stable Transfer RNA Translocation through the Ribosome Ensured by Specific Contact Mechanisms​
    Bock, L. V. ; Blau, C. ; Schröder, G. F.; Davydov, I. I.; Fischer, N. ; Stark, H.   & Rodnina, M. V.  et al.​ (2014)
    ​Biophysical Journal, 106(Supplement 1), 493a-493a.. ​58th Annual Meeting of the Biophysical-Society​, San Francisco, CA.
    Cambridge​: Cell Press. DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.11.2758 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2014 | Conference Abstract
    ​ ​Ribosomal Kinetics and Concerted Motions from Nanoseconds to Seconds​
    Blau, C. ; Bock, L. V. ; Schröder, G. F.; Davydov, I. I.; Fischer, N. ; Stark, H.   & Rodnina, M. V.  et al.​ (2014)
    ​Biophysical Journal , Volume 106 , Issue 2 , 250a p. 1266-Plat. ​58th Annual Meeting of the Biophysical-Society​, San Francisco, CA.
    Cambridge​: Cell Press. DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.11.1463 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2014 | Journal Article | Erratum
    ​ ​Erratum: “Auger spectrum of a water molecule after single and double core ionization” [J. Chem. Phys. 136, 144304 (2012)]​
    Inhester, L.; Burmeister, C. F.; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    The Journal of Chemical Physics, 141(6) pp. 069904​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.4892982 
    ​Details  DOI 
  • 2014 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Expansion of the fusion stalk and its implication for biological membrane fusion​
    Risselada, H. J. ; Bubnis, G. & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences, 111(30) pp. 11043​-11048​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.1323221111 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2014 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Quantifying Artifacts in Ewald Simulations of Inhomogeneous Systems with a Net Charge​
    Hub, J. S. ; Groot, B. L. de ; Grubmüller, H.   & Groenhof, G. ​ (2014) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 10(1) pp. 381​-390​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ct400626b 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2014 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Hydrogen bond dynamics of superheated water and methanol by ultrafast IR-pump and EUV-photoelectron probe spectroscopy​
    Voehringer-Martinez, E.; Link, O. ; Lugovoy, E.; Siefermann, K. R.; Wiederschein, F. ; Grubmüller, H.   & Abel, B. ​ (2014) 
    Physical Chemistry Chemical Physics, 16(36) pp. 19365​-19375​.​ DOI: https://doi.org/10.1039/c4cp02063d 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2014 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Free Energy Landscape of Rim-Pore Expansion in Membrane Fusion​
    Risselada, H. J. ; Smirnova, Y.   & Grubmüller, H. ​ (2014) 
    Biophysical Journal, 107(10) pp. 2287​-2295​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.08.022 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Charge Separation in Water on Strong Impacts and Recombination of Dispersed Ions​
    Wiederschein, F. ; Vöhringer-Martinez, E.; Abel, B.   & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 506a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.2793 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Quantifying Disorder through Conditional Entropy: An Application to Fluid Mixing​
    Brandani, G.; Schor, M.; MacPhee, C.; Grubmüller, H. ; Zachariae, U. & Marenduzzo, D.​ (2013) 
    PLoS ONE, 8(6) art. e65617​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0065617 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​g_contacts: Fast contact search in bio-molecular ensemble data​
    Blau, C.   & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Computer Physics Communications, 184(12) pp. 2856​-2859​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2013.07.018 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Core hole screening and decay rates of double core ionized first row hydrides​
    Inhester, L.; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    The Journal of Chemical Physics, 138(16) art. 164304​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.4801660 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Modulation of Intersubunit Interactions during tRNA Translocation through the Ribosome​
    Vaiana, A. C.; Bock, L. V.; Blau, C.; Schroeder, G. F.; Fischer, N. ; Stark, H.   & Rodnina, M.  et al.​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 258a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.1447 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Influenza Virus Binds its Host Cell using Multiple Dynamic Interactions Revealed by Single Virus Force Spectroscopy and Force Probe Molecular Dynamics​
    Herrmann, A.; Sieben, C.; Kappel, C.; Zhu, R.; Rankl, C.; Wozniak, A. & Hinterdorfer, P. et al.​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) art. 415a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.2312 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Proteins in the gas phase​
    Meyer, T. ; Gabelica, V.; Grubmüller, H.   & Orozco, M.​ (2013) 
    Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science, 3(4) pp. 408​-425​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/wcms.1130 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Force Distribution Analysis of Mechanochemically Reactive Dimethylcyclobutene​
    Li, W.; Edwards, S. A.; Lu, L.; Kubar, T.; Patil, S. P.; Grubmüller, H.   & Groenhof, G.  et al.​ (2013) 
    ChemPhysChem, 14(12) pp. 2687​-2697​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/cphc.201300252 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​In silico FRET from simulated dye dynamics​
    Hoefling, M. & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Computer Physics Communications, 184(3) pp. 841​-852​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2012.10.018 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Structural Determinants of Conformational Flexibility and Long-Range Allostery of the CRM1 Export Complex​
    Monecke, T. ; Haselbach, D.; Voß, B.; Russek, A.; Neumann, P. ; Thomson, E. & Hurt, E. et al.​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2, Supplement 1) pp. 68a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.411 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Conference Abstract
    ​ ​Fusion Proteins - Different Tools for Different Jobs?​
    Risselada, H. J. ; Müller, M.   & Grubmüller, K. H. ​ (2013)
    Biophysical Journal, 104(2) p. 664a. , Philadelphia, PA.
    Cambridge​: Cell Press. DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.3664 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Dynamics of the Ribosomal Subunit Interface during TRNA Translocation at Near-Atomic Resolution​
    Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 4a​-5a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.046 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Dynamics of C-Terminal Gtα and Gsα Peptides in the Binding Cavity of Active GPCRs​
    Rose, A. S.; Zachariae, U.; Scheerer, P.; Grubmüller, H. ; Hofmann, K. P. & Hildebrand, P. W.​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 538a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.2977 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Heat Transfer Pathways in Proteins​
    Graen, T. M. & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 685a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.3783 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Enforced Unfolding and Mechanical Properties of the Importin-Beta and Importin-Beta-Binding-Domain Complex​
    Russek, A. & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 557a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.3086 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Exploring Protein Energy Landscapes with Time-Dependent Principal Component Analysis​
    Volkhardt, A.; Meyer, T.   & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 171a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.963 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Structural Ensembles of Intrinsically Disordered FG-Nucleoporins Depend on Force Field​
    Rauscher, S. & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 15a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.115 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Reaction Control in Fungal Fatty Acid Synthase​
    Buelens, F.; Grininger, M. & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 666a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.3675 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Rate Estimates from Sampling Sparse Transitions: TRNA Motion Limits Transitions between Ribosomal Translocation Intermediates​
    Blau, C. ; Bock, L. V. ; Schröder, G. F.; Fischer, N. ; Stark, H. ; Rodnina, M. V.   & Vaiana, A. C.  et al.​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 663a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.3662 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article
    ​ ​Mechanisms for Efficient TRNA Translocation through the Ribosome​
    Bock, L. V. ; Blau, C. ; Schröder, G. F.; Fischer, N. ; Stark, H. ; Rodnina, M. V.   & Vaiana, A. C.  et al.​ (2013) 
    Biophysical Journal, 104(2) pp. 16a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2012.11.118 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article | Erratum
    ​ ​Correction to Constant pH Molecular Dynamics in Explicit Solvent with λ-Dynamics​
    Donnini, S.; Tegeler, F. ; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2013) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 9(7) pp. 3261​-3261​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ct400439g 
    ​Details  DOI 
  • 2013 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Structural Determinants and Mechanism of Mammalian CRM1 Allostery​
    Doelker, N.; Blanchet, C. E.; Voss, B.; Haselbach, D.; Kappel, C.; Monecke, T.   & Svergun, D. I. et al.​ (2013) 
    Structure, 21(8) pp. 1350​-1360​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2013.05.015 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2013 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Structural basis for cooperativity of CRM1 export complex formation​
    Monecke, T. ; Haselbach, D.; Voss, B.; Russek, A.; Neumann, P. ; Thomson, E. & Hurt, E. et al.​ (2013) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences, 110(3) pp. 960​-965​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.1215214110 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2013 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate clusters act as molecular beacons for vesicle recruitment​
    Honigmann, A.; van den Bogaart, G.; Iraheta, E.; Risselada, H. J. ; Milovanovic, D. ; Mueller, V. & Müllar, S. et al.​ (2013) 
    Nature Structural & Molecular Biology, 20(6) pp. 679​-686​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nsmb.2570 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2013 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Energy barriers and driving forces in tRNA translocation through the ribosome​
    Bock, L. V. ; Blau, C. ; Schroeder, G. F.; Davydov, I. I.; Fischer, N. ; Stark, H.   & Rodnina, M. V.  et al.​ (2013) 
    Nature Structural & Molecular Biology, 20(12) pp. 1390​-1396​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nsmb.2690 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Efficient binding of 4/7 α-conotoxins to nicotinic α4β2 receptors is prevented by Arg185 and Pro195 in the α4 subunit​
    Beissner, M.; Dutertre, S.; Schemm, R.; Danker, T.; Sporning, A.; Grubmüller, H.   & Nicke, A.​ (2012) 
    Molecular Pharmacology, 82(4) pp. 711​-718​.​ DOI: https://doi.org/10.1124/mol.112.078683 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Auger spectrum of a water molecule after single and double core ionization​
    Inhester, L.; Burmeister, C.; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    The Journal of Chemical Physics, 136(14) art. 144304​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.3700233 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Quantitative assessment of protein interaction with methyl-lysine analogues by hybrid computational and experimental approaches​
    Seeliger, D.; Soeroes, S.; Klingberg, R.; Schwarzer, D. ; Grubmüller, H.   & Fischle, W.​ (2012) 
    ACS Chemical Biology, 7(1) pp. 150​-154​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/cb200363r 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Linear-scaling soft-core scheme for alchemical free energy calculations​
    Buelens, F. P. & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    Journal of Computational Chemistry, 33(1) pp. 25​-33​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.21938 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Influenza virus binds its host cell using multiple dynamic interactions​
    Sieben, C.; Kappel, C.; Zhu, R.; Wozniak, A.; Rankl, C.; Hinterdorfer, P. & Grubmüller, H.  et al.​ (2012) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 109(34) pp. 13626​-13631​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.1120265109 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​α-Synuclein Monomer Conformations Studied by in Silico and in Vitro FRET​
    Klement, R.; Grubmüller, H.   & Haas, E.​ (2012) 
    Biophysical Journal, 102(3) pp. 630a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.3430 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Auger Spectrum of a Water Molecule after Single and Double Core-Ionization by Intense X-Ray Radiation​
    Inhester, L.; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    Biophysical Journal, 102(3) pp. 392a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.2141 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Specificity Profiles for DNA-Binding Proteins from Exhaustive In-Silico Screening​
    Seeliger, D.; Buelens, F. P.; Goette, M.; de Groot, B. L.   & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    Biophysical Journal, 102(3) pp. 73a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.429 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​The Dynasome as the Missing Link Between Protein Structure and Function​
    Meyer, T. ; Hensen, U.; Haas, J.; Rex, R. ; Vriend, G. & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    Biophysical Journal, 102(3) pp. 449a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.2465 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Computer Aided Distance Reconstruction in Single Molecule FRET Experiments through Combination with Dye Dynamics from Molecular Dynamics Simulations​
    Hoefling, M. & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    Biophysical Journal, 102(3) pp. 404a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.2205 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Computational Electrophysiology Reveals Ion Channel Permeation in Atomistic Detail​
    Zachariae, U.; Kutzner, C.; Grubmüller, H.   & de Groot, B. L. ​ (2012) 
    Biophysical Journal, 102(3) pp. 22a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.147 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Efficient Dynamic Protonation and Constant pH Simulations with Explicit Solvent: Calculation of Apparent pKa Values in Proteins​
    Dobrev, P.; Donnini, S.; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    Biophysical Journal, 102(3) pp. 40a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.245 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article
    ​ ​Contacts Between Ribosome Parts Refined by Molecular Dynamics Simulations​
    Blau, C. ; Bock, L. V. ; Schroeder, G. F.; Fischer, N. ; Stark, H. ; Vaiana, A. C.   & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    Biophysical Journal, 102(3) pp. 69a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.405 
    ​Details  DOI 
  • 2012 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Exploring Protein Dynamics Space: The Dynasome as the Missing Link between Protein Structure and Function​
    Hensen, U.; Meyer, T. ; Haas, J.; Rex, R. ; Vriend, G. & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    PLoS ONE, 7(5) art. e33931​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0033931 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2012 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Line-Tension Controlled Mechanism for Influenza Fusion​
    Risselada, H. J. ; Marelli, G.; Fuhrmans, M.; Smirnova, Y. G. ; Grubmüller, H. ; Marrink, S. J. & Mueller, M. ​ (2012) 
    PLoS ONE, 7(6) art. e38302​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0038302 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2012 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​How SNARE molecules mediate membrane fusion: Recent insights from molecular simulations​
    Risselada, H. J.   & Grubmüller, H. ​ (2012) 
    Current Opinion in Structural Biology, 22(2) pp. 187​-196​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.sbi.2012.01.007 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2011 | Journal Article
    ​ ​Computational electrophysiology: the molecular dynamics of ion channel permeation and selectivity in atomistic detail​
    Kutzner, C.; Grubmüller, H. ; de Groot, B. L.   & Zachariae, U.​ (2011) 
    Biophysical Journal, 101(4) pp. 809​-817​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.06.010 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2011 | Journal Article
    ​ ​Determining equilibrium constants for dimerization reactions from molecular dynamics simulations​
    De Jong, D. H.; Schäfer, L. ; de Vries, A.; Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. & Grubmüller, H. ​ (2011) 
    Journal of Computational Chemistry, 32(9) pp. 1919​-1928​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.21776 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2011 | Journal Article
    ​ ​Constant pH Molecular Dynamics in Explicit Solvent with λ-Dynamics​
    Donnini, S.; Tegeler, F. ; Groenhof, G.   & Grubmüller, H. ​ (2011) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 7(6) pp. 1962​-1978​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ct200061r 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2011 | Journal Article
    ​ ​Keep It Flexible: Driving Macromolecular Rotary Motions in Atomistic Simulations with GROMACS​
    Kutzner, C.; Czub, J. & Grubmüller, H. ​ (2011) 
    Journal of Chemical Theory and Computation, 7(5) pp. 1381​-1393​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ct100666v 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2011 | Journal Article
    ​ ​Torsional elasticity and energetics of F1-ATPase​
    Czub, J. & Grubmüller, H. ​ (2011) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 108(18) pp. 7408​-7413​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.1018686108 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2011 | Journal Article
    ​ ​Caught in the act: visualization of SNARE-mediated fusion events in molecular detail​
    Risselada, H. J. ; Kutzner, C. & Grubmüller, H. ​ (2011) 
    Chembiochem : a European journal of chemical biology, 12(7) pp. 1049​-1055​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/cbic.201100020 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2011 | Journal Article
    ​ ​Velocity-dependent mechanical unfolding of bacteriorhodopsin is governed by a dynamic interaction network​
    Kappel, C. & Grubmüller, H. ​ (2011) 
    Biophysical Journal, 100(4) pp. 1109​-1119​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.01.004 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2011 | Conference Abstract
    ​ ​Allostery in nuclear export: a hybrid methods approach​
    Doelker, N.; Blanchet, C.; Monecke, T.; Svergun, D. I.; Ficner, R. ; Grubmüller, H.   & Dickmanns, A.​ (2011)
    European Biophysics Journal, 40 pp. 104​-105. , Budapest, HUNGARY.
    New york​: Springer.
    ​Details  WoS 
  • 2011 | Journal Article
    ​ ​Structural heterogeneity and quantitative FRET efficiency distributions of polyprolines through a hybrid atomistic simulation and Monte Carlo approach​
    Hoefling, M.; Lima, N.; Haenni, D.; Seidel, C. A. M.; Schuler, B. & Grubmüller, H. ​ (2011) 
    PLOS ONE, 6(5) art. e19791​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019791 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2011 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Kinetics of Conformational Sampling in Ubiquitin​
    Ban, D. ; Funk, M.; Gulich, R.; Egger, D.; Sabo, T. M. ; Walter, K. F. A. & Fenwick, R. B. et al.​ (2011) 
    Angewandte Chemie International Edition, 50(48) pp. 11437​-11440​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/anie.201105086 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2011 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Towards computional specificity screening of DNA-binding proteins​
    Seeliger, D.; Buelens, F. P.; Goette, M.; Groot, B. L. de   & Grubmüller, H. ​ (2011) 
    Nucleic Acids Research, 39(19) pp. 8281​-8290​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkr531 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2011 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Synaptotagmin-1 may be a distance regulator acting upstream of SNARE nucleation​
    van den Bogaart, G.; Thutupalli, S.; Risselada, J. H. ; Meyenberg, K.; Holt, M. ; Riedel, D.   & Diederichsen, U.  et al.​ (2011) 
    Nature Structural & Molecular Biology, 18(7) pp. 805​-U82​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nsmb.2061 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2011 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Membrane protein sequestering by ionic protein-lipid interactions​
    van den Bogaart, G.; Meyenberg, K.; Risselada, H. J. ; Amin, H.; Willig, K. I. ; Hubrich, B. E. & Dier, M. et al.​ (2011) 
    Nature, 479(7374) pp. 552​-555​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nature10545 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​Quantitative structural analysis of importin-β flexibility: paradigm for solenoid protein structures​
    Forwood, J.; Lange, A.; Zachariae, U.; Marfori, M.; Preast, C.; Grubmüller, H.   & Stewart, M. et al.​ (2010) 
    Structure, 18(9) pp. 1171-83​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2010.06.015 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​Chemomechanical regulation of SNARE proteins studied with molecular dynamics simulations​
    Bock, L. V. ; Hutchings, B.; Grubmüller, H.   & Woodbury, D. J.​ (2010) 
    Biophysical Journal, 99(4) pp. 1221​-1230​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2010.06.019 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​g_membed: Efficient insertion of a membrane protein into an equilibrated lipid bilayer with minimal perturbation​
    Wolf, M.; Hoefling, M.; Aponte-Santamaria, C.; Grubmüller, H.   & Groenhof, G. ​ (2010) 
    Journal of Computational Chemistry, 31(11) pp. 2169​-2174​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.21507 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​Hydrophilic linkers and polar contacts affect aggregation of FG repeat peptides​
    Dölker, N.; Zachariae, U. & Grubmüller, H. ​ (2010) 
    Biophysical Journal, 98(11) pp. 2653​-2661​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2010.02.049 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​A "force buffer" protecting immunoglobulin titin​
    Nunes, M. J.; Hensen, U.; Ge, L.; Lipinsky, M.; Helenius, J.; Grubmüller, H.   & Muller, D. J​ (2010) 
    Angewandte Chemie International Edition, 49(20) pp. 3528​-3531​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/anie.200906388 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​Estimating absolute configurational entropies of macromolecules: the minimally coupled subspace approach​
    Hensen, U.; Lange, O. F. & Grubmüller, H. ​ (2010) 
    PloS one, 5(2) art. e9179​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009179 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​Primary changes of the mechanical properties of Southern Bean Mosaic Virus upon calcium removal​
    Zink, M. & Grubmüller, H. ​ (2010) 
    Biophysical Journal, 98(4) pp. 687​-695​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2009.10.047 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​Chemomechanical Regulation of Snare Proteins Studied with Molecular Dynamics Simulations​
    Bock, L. ; Hutchings, B.; Grubmüller, H.   & Woodbury, D. J.​ (2010) 
    Biophysical Journal, 98(3) pp. 677a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2009.12.3723 
    ​Details  DOI 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​Structural basis for CRM1 nuclear export complex assembly​
    Monecke, T. ; Güttler, T.; Neumann, P. ; Doelker, N.; Blanchet, C.; Dickmanns, A.   & Görlich, D. et al.​ (2010) 
    Acta Crystallographica. Section A, Foundations and Advances, 66(a1) pp. s30​-s31​.​ DOI: https://doi.org/10.1107/S0108767310099319 
    ​Details  DOI 
  • 2010 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Voltage-Regulated Water Flux through Aquaporin Channels In Silico​
    Hub, J. S. ; Aponte-Santamaria, C.; Grubmüller, H.   & Groot, B. L. de ​ (2010) 
    Biophysical Journal, 99(12) pp. L97​-L99​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2010.11.003 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2010 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Molecular Basis of the Light-driven Switching of the Photochromic Fluorescent Protein Padron​
    Brakemann, T. ; Weber, G. ; Andresen, M. ; Groenhof, G. ; Stiel, A. C. ; Trowitzsch, S.   & Eggeling, C.  et al.​ (2010) 
    Journal of biological chemistry, 285(19) pp. 14603​-14609​.​ DOI: https://doi.org/10.1074/jbc.M109.086314 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2010 | Journal Article
    ​ ​An unusual hydrophobic core confers extreme flexibility to HEAT repeat proteins​
    Kappel, C.; Zachariae, U.; Dölker, N. & Grubmüller, H. ​ (2010) 
    Biophysical Journal, 99(5) pp. 1596​-1603​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2010.06.032 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Adaptive anisotropic kernels for nonparametric estimation of absolute configurational entropies in high-dimensional configuration spaces​
    Hensen, U.; Grubmüller, H.   & Lange, O. F.​ (2009) 
    Physical Review E, 80(1) art. 011913​.​ DOI: https://doi.org/10.1103/PhysRevE.80.011913 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Urea impedes the hydrophobic collapse of partially unfolded proteins​
    Stumpe, M. C. & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Biophysical Journal, 96(9) pp. 3744​-3752​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2009.01.051 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Accuracy and convergence of free energy differences calculated from nonequilibrium switching processes​
    Goette, M. & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Journal of Computational Chemistry, 30(3) pp. 447​-456​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.21073 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​g_permute: Permutation-reduced phase space density compaction​
    Reinhard, F. ; Lange, O. F.; Hub, J. S. ; Haas, J. & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Computer Physics Communications, 180(3) pp. 455​-458​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2008.10.018 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Simulation of a Complete Viral Shell​
    Zink, M. & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Innovatives Supercomputing in Deutschland, 7 pp. 22​-25​.​
    ​Details 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Mechanical Properties of the Icosahedral Shell of Southern Bean Mosaic Virus: A Molecular Dynamics Study​
    Zink, M. & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Biophysical Journal, 96(4) pp. 1350​-1363​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2008.11.028 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​The Flexibility of Unbound Importin-beta studied by Molecular Dynamics​
    Kappel, C. & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Biophysical Journal, 96(3) pp. 378a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2008.12.2833 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​The mechanical properties of the icosahedral shell of Southern Bean Mosaic Virus - A molecular dynamics study​
    Zink, M. & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Biophysical Journal, 96(3) pp. 421a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2008.12.2153 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​In Silico Examination Of The Influence Of Nucleotide Modifications And Magnesium Ions On tRNA Structure And Dynamics​
    Blau, C.; Groenhof, G. & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Biophysical Journal, 96(3) pp. 302a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2008.12.1501 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Primary Steps of pH-Dependent Insulin Aggregation Kinetics are Governed by Conformational Flexibility​
    Haas, J.; Vöhringer-Martinez, E.; Bögehold, A.; Matthes, D. ; Hensen, U.; Pelah, A. & Abel, B.  et al.​ (2009) 
    ChemBioChem, 10(11) pp. 1816​-1822​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/cbic.200900266 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Inside Cover: Primary Steps of pH‐Dependent Insulin Aggregation Kinetics are Governed by Conformational Flexibility (ChemBioChem 11/2009)​
    Haas, J.; Vöhringer-Martinez, E.; Bögehold, A.; Matthes, D. ; Hensen, U.; Pelah, A. & Abel, B.  et al.​ (2009) 
    ChemBioChem, 10(11) pp. 1742​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/cbic.200990042 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Ultrafast phase transitions in metastable water near liquid interfaces​
    Link, O. ; Vöhringer-Martinez, E.; Lugovoj, E.; Liu, Y.; Siefermann, K.; Faubel, M. & Grubmüller, H.  et al.​ (2009) 
    Faraday Discussions, 141 pp. 67​-79​.​ DOI: https://doi.org/10.1039/B811659H 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article
    ​ ​Single-Molecule Force Spectroscopy Reveals the Function of Titin Kinase as Force Sensor​
    Puchner, E. M.; Alexandrovich, A.; Kho, A. L.; Hensen, U.; Schäfer, L. V.; Brandmeier, B. & Gräter, F. et al.​ (2009) 
    Biophysical Journal, 96(3) pp. 643a​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2008.12.3401 
    ​Details  DOI 
  • 2009 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Molecular Determinants of Snurportin 1 Ligand Affinity and Structural Response upon Binding​
    Goette, M.; Stumpe, M. C.; Ficner, R.   & Grubmüller, H. ​ (2009) 
    Biophysical Journal, 97(2) pp. 581​-589​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2009.04.049 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2009 | Review
    ​ ​Kinase-activity-independent functions of atypical protein kinase C in Drosophila​
    Kim, S. ; Gailite, I. ; Moussian, B.; Luschnig, S.; Goette, M.; Fricke, K.  & Honemann-Capito, M.  et al.​ (2009)
    Journal of Cell Science, 122​(20) pp. 3759​-3771​.​ DOI: https://doi.org/10.1242/jcs.052514 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Journal Article
    ​ ​Single-molecule FRET measures bends and kinks in DNA​
    Wozniak, A. K.; Schröder, G. F.; Grubmüller, H. ; Seidel, C. A. M. & Oesterhelt, F.​ (2008) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105(47) pp. 18337​-18342​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.0800977105 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2008 | Journal Article
    ​ ​Polar or apolar - the role of polarity for urea-induced protein denaturation​
    Stumpe, M. C. & Grubmüller, H. ​ (2008) 
    PLoS Computational Biology, 4(11) art. e1000221​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000221 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2008 | Journal Article
    ​ ​Mechanoenzymatics of titin kinase​
    Puchner, E. M; Alexandrovich, A.; Kho, A. L.; Hensen, U.; Schäfer, L. ; Brandmeier, B. & Gräter, F.  et al.​ (2008) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105(36) pp. 13385​-13390​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.0805034105 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2008 | Journal Article
    ​ ​Importin-β: structural and dynamic determinants of a molecular spring​
    Zachariae, U. & Grubmüller, H. ​ (2008) 
    Structure, 16(6) pp. 906​-915​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2008.03.007 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2008 | Journal Article
    ​ ​Chromophore protonation state controls photoswitching of the fluoroprotein asFP595​
    Schäfer, L. ; Groenhof, G. ; Boggio-Pasqua, M.; Robb, M. & Grubmüller, H. ​ (2008) 
    PLoS Computational Biology, 4(3) art. e1000034​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000034 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2008 | Journal Article
    ​ ​Arginine52 controls the photoisomerization process in photoactive yellow protein​
    Groenhof, G. ; Schäfer, L. ; Boggio-Pasqua, M.; Grubmüller, H.   & Robb, M.​ (2008) 
    Journal of the American Chemical Society, 130(11) pp. 3250​-3251​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ja078024u 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2008 | Journal Article
    ​ ​Full correlation analysis of conformational protein dynamics​
    Lange, O. F. & Grubmüller, H. ​ (2008) 
    Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 70(4) pp. 1294​-1312​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/prot.21618 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2008 | Journal Article
    ​ ​Folding and assembly of proteorhodopsin​
    Klyszejko, A. L.; Shastri, S.; Mari, S. A.; Grubmüller, H. ; Muller, D. J & Glaubitz, C.​ (2008) 
    Journal of Molecular Biology, 376(1) pp. 35​-41​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmb.2007.11.030 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2008 | Book Chapter
    ​ ​Dynamics and Energetics of Permeation Through Aquaporins. What Do We Learn from Molecular Dynamics Simulations?​
    Hub, J. S. ; Grubmüller, H.  & Groot, B. L. de ​ (2008)
    In:​Beitz, E.​ (Ed.), Aquaporins pp. 57​-76. ​Heidelberg: ​Springer Nature. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-540-79885-9_3 
    ​Details  DOI 
  • 2008 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​RGe(I)Ge(I)R Compound (R = PhC(NtBu)(2))with a Ge-Ge Single Bond and a Comparison with the Gauche Conformation of Hydrazine​
    Nagendran, S.; Sen, S. S.; Roesky, H. W. ; Koley, D.; Grubmüller, H. ; Pal, A. & Herbst-Irmer, R. ​ (2008) 
    Organometallics, 27(21) pp. 5459​-5463​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/om800714f 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2008 | Journal Article | Erratum
    ​ ​Correction for Puchner et al., Mechanoenzymatics of titin kinase​
    Puchner, E. M.; Alexandrovich, A.; Kho, A. L.; Hensen, U.; Schäfer, L. V.; Brandmeier, B. & Gräter, F. et al.​ (2008) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105(52) pp. 21045​-21045​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.0810209105 
    ​Details  DOI 
  • 2008 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Recognition dynamics up to microseconds revealed from an RDC-derived ubiquitin ensemble in solution​
    Lange, O. F.; Lakomek, N.-A. ; Farès, C.; Schroeder, G. F.; Walter, K. F. A.; Becker, S.   & Meiler, J. et al.​ (2008) 
    Science, 320(5882) pp. 1471​-1475​.​ DOI: https://doi.org/10.1126/science.1157092 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Kinetics, statistics, and energetics of lipid membrane electroporation studied by molecular dynamics simulations​
    Böckmann, R. A.; Groot, B. L. de ; Kakorin, S.; Neumann, E. & Grubmüller, H. ​ (2008) 
    Biophysical Journal, 95(4) pp. 1837​-1850​.​ DOI: https://doi.org/10.1529/biophysj.108.129437 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Self-consistent residual dipolar coupling based model-free analysis for the robust determination of nanosecond to microsecond protein dynamics​
    Lakomek, N.-A. ; Walter, K. F. A.; Farès, C.; Lange, O. F.; Groot, B. L. de ; Grubmüller, H.   & Brueschweiler, R. et al.​ (2008) 
    Journal of Biomolecular NMR, 41(3) pp. 139​-155​.​ DOI: https://doi.org/10.1007/s10858-008-9244-4 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Journal Article | Research Paper | 
    ​ ​Is TEA an inhibitor for human aquaporin-1?​
    Mueller, E. M.; Hub, J. S. ; Grubmüller, H.   & Groot, B. L. de ​ (2008) 
    Pflügers Archiv European Journal of Physiology, 456(4) pp. 663​-669​.​ DOI: https://doi.org/10.1007/s00424-007-0422-0 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Residual dipolar couplings as a tool to study molecular recognition of ubiquitin​
    Lakomek, N.-A. ; Lange, O. F.; Walter, K. F. A.; Farès, C.; Egger, D.; Lunkenheimer, P. & Meiler, J. et al.​ (2008) 
    Biochemical Society transactions, 36 pp. 1433​-1437​.​ DOI: https://doi.org/10.1042/BST0361433 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Photoswitching of the Fluorescent Protein asFP595: Mechanism, Proton Pathways, and Absorption Spectra​
    Schäfer, L. ; Groenhof, G. ; Klingen, A.; Ullmann, G.; Boggio-Pasqua, M.; Robb, M. & Grubmüller, H. ​ (2007) 
    Angewandte Chemie International Edition, 46(4) pp. 530​-536​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/ange.200602315 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​A Molecular Dynamics Study of Slow Base Flipping in DNA using Conformational Flooding​
    Bouvier, B. & Grubmüller, H. ​ (2007) 
    Biophysical Journal, 93(3) pp. 770​-786​.​ DOI: https://doi.org/10.1529/biophysj.106.091751 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Ultrafast Deactivation Channel for Thymine Dimerization​
    Boggio-Pasqua, M.; Groenhof, G. ; Schäfer, L. V. ; Grubmüller, H.   & Robb, M. A.​ (2007) 
    Journal of the American Chemical Society, 129(36) pp. 10996​-10997​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ja073628j 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Interaction of Urea with Amino Acids: Implications for Urea-Induced Protein Denaturation​
    Stumpe, M. C. & Grubmüller, H. ​ (2007) 
    Journal of the American Chemical Society, 129(51) pp. 16126​-16131​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ja076216j 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Elastic Properties of Photoswitchable Azobenzene Polymers from Molecular Dynamics Simulations​
    Schäfer, L. ; Müller, E.; Gaub, H. E. & Grubmüller, H. ​ (2007) 
    Angewandte Chemie International Edition, 46(13) pp. 2232​-2237​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/anie.200604595 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Aqueous Urea Solutions: Structure, Energetics, and Urea Aggregation​
    Stumpe, M. C. & Grubmüller, H. ​ (2007) 
    The Journal of Physical Chemistry B, 111(22) pp. 6220​-6228​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/jp066474n 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Estimation of absolute solvent and solvation shell entropies via permutation reduction​
    Reinhard, F.   & Grubmüller, H. ​ (2007) 
    The Journal of Chemical Physics, 126(1) art. 014102​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.2400220 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Molecular dynamics simulation of lipids and lipid embossed proteins​
    Bockmann, R.; Kappel, C. & Grubmüller, H. ​ (2007) 
    Chemistry and Physics of Lipids, 149 pp. S4​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.chemphyslip.2007.06.009 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Wunderwerke der Evolution​
    Grubmüller, H. ​ (2007) 
    Physik in unserer Zeit, 39(1).​ DOI: https://doi.org/10.1002/piuz.200790102 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Fluctuations of primary ubiquitin folding intermediates in a force clamp​
    Gräter, F. ​ (2007) 
    Journal of Structural Biology, 157(3) pp. 557​-569​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.jsb.2006.11.005 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article
    ​ ​Ultrafast Deactivation of an Excited Cytosine−Guanine Base Pair in DNA​
    Groenhof, G. ; Schäfer, L. V. ; Boggio-Pasqua, M.; Goette, M.; Grubmüller, H.   & Robb, M. A.​ (2007) 
    Journal of the American Chemical Society, 129(21) pp. 6812​-6819​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ja069176c 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Journal Article | Editorial Contribution (Editorial, Introduction, Epilogue)
    ​ ​Editorial: Special issue: Advances in molecular dynamics simulations​
    Grubmüller, H.   & Schulten, K. ​ (2007) 
    Journal of Structural Biology, 157(3) pp. 443​-443​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.jsb.2007.02.002 
    ​Details  DOI 
  • 2007 | Conference Abstract
    ​ ​Molecular Dynamics simulation of the liquid phase desorption mechanism of biomolecules​
    Wiederschein, F. ; Vohringer-Martinez, E.; Abel, B. & Grubmüller, H. ​ (2007)
    Biophysical Journal, ​51st Annual Meeting of the Biophysical-Society​, Baltimore, MD.
    Cambridge​: Cell Press.
    ​Details  WoS 
  • 2007 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Anatomy and dynamics of a supramolecular membrane protein cluster​
    Sieber, J. J.; Willig, K. I. ; Kutzner, C.; Gerding-Reimers, C.; Harke, B.; Donnert, G. & Rammner, B. et al.​ (2007) 
    Science, 317(5841) pp. 1072​-1076​.​ DOI: https://doi.org/10.1126/science.1141727 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2007 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Speeding up parallel GROMACS on high-latency networks​
    Kutzner, C.; Van der Spoel, D.; Fechner, M.; Lindahl, E.; Schmitt, U. W.; Groot, B. L. de   & Grubmüller, H. ​ (2007) 
    Journal of Computational Chemistry, 28(12) pp. 2075​-2084​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.20703 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Journal Article
    ​ ​Molekulare Nanomaschinen unter der Lupe: Proteindynamik-Simulationen​
    Groot, B. L. de ; Böckmann, R. A. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    Physik in unserer Zeit, 37(2) pp. 73​-79​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/piuz.200501098 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Journal Article | Editorial Contribution (Editorial, Introduction, Epilogue)
    ​ ​Editorial: Nonequilibrium dynamics in biomolecules​
    Stock, G. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    Chemical Physics, 323(1) pp. 1​-1​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.chemphys.2005.08.043 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Journal Article
    ​ ​Collective Langevin dynamics of conformational motions in proteins​
    Lange, O. F. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    The Journal of Chemical Physics, 124(21) art. 214903​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.2199530 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Journal Article
    ​ ​Pheromone Discrimination by the Pheromone-Binding Protein of Bombyx mori​
    Gräter, F. ; Xu, W.; Leal, W. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    Structure, 14(10) pp. 1577​-1586​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2006.08.013 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Journal Article
    ​ ​Can Principal Components Yield a Dimension Reduced Description of Protein Dynamics on Long Time Scales?​
    Lange, O. F. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    The Journal of Physical Chemistry B, 110(45) pp. 22842​-22852​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/jp062548j 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Book Chapter
    ​ ​Improved GROMACS Scaling on Ethernet Switched Clusters​
    Kutzner, C.; Van der Spoel, D.; Fechner, M.; Lindahl, E.; Schmitt, U. W.; Groot, B. L. de  & Grubmüller, H. ​ (2006)
    In:​Träff, Jesper Larsson; Mohr, Bernd; Worringen, Joachim; Dongarra, Jack​ (Eds.), Recent Advances in Parallel Virtual Machine and Message Passing Interface pp. 404​-405.  DOI: https://doi.org/10.1007/11846802_57 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Journal Article
    ​ ​A Highly Strained Nuclear Conformation of the Exportin Cse1p Revealed by Molecular Dynamics Simulations​
    Zachariae, U. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    Structure, 14(9) pp. 1468​-1478​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2006.08.001 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Journal Article
    ​ ​Generalized Correlation for Biomolecular Dynamics​
    Lange, O. F. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 62(4) pp. 1053​-1061​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/prot.20784 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Journal Article
    ​ ​Prediction of a RanGTP-induced conformational switch in the exportin CAS/Cse1p by molecular dynamics simulations​
    Zachariae, U. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    MPIbpc News, 5 pp. 1​-6​.​
    ​Details 
  • 2006 | Journal Article
    ​ ​Flooding in GROMACS: Accelerated Barrier Crossings in Molecular Dynamics​
    Lange, O. F.; Schäfer, L. V.   & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    J Comput Chem., 27(14) pp. 1693​-1702​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.20473 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Sequential N- to C-terminal SNARE complex assembly drives priming and fusion of secretory vesicles​
    Sørensen, J. B.; Wiederhold, K.; Müller, E. M.; Milosevic, I. ; Nagy, G.; de Groot, B. L.   & Grubmüller, H.  et al.​ (2006) 
    EMBO Journal, 25(5) pp. 955​-966​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/sj.emboj.7601003 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Ligand-release pathways in the pheromone-binding protein of Bombyx mori​
    Graeter, F. ; de Groot, B. L. ; Jiang, H. & Grubmüller, H. ​ (2006) 
    Structure, 14(10) pp. 1567​-1576​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2006.08.012 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Molecular anatomy of a trafficking organelle​
    Takamori, S.; Holt, M. ; Stenius, K.; Lemke, E. A.; Gronborg, M.; Riedel, D.   & Urlaub, H.  et al.​ (2006) 
    Cell, 127(4) pp. 831​-846​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2006.10.030 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Quaternary ammonium compounds as water channel blockers - Specificity, potency, and site of action​
    Detmers, F. J. M.; de Groot, B. L. ; Müller, E. M.; Hinton, A.; Konings, I. B. M.; Sze, M. & Flitsch, S. L. et al.​ (2006) 
    Journal of biological chemistry, 281(20) pp. 14207​-14214​.​ DOI: https://doi.org/10.1074/jbc.M513072200 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Book Chapter
    ​ ​Force probe molecular dynamics simulations​
    Grubmüller, H. ​ (2005)
    In:​Nienhaus, Ulrich G.​ (Ed.), Proteinligand Interactions: methods and applications pp. 493​-515. ​Totowa: ​Humana Press.
    ​Details 
  • 2005 | Journal Article
    ​ ​Mechanically Induced Titin Kinase Activation Studied by Force-Probe Molecular Dynamics Simulations​
    Gräter, F. ; Grubmüller, H. ; Jiang, H.; Shen, J. & Gautel, M.​ (2005) 
    Biophys J., 88(2) pp. 790​-804​.​ DOI: https://doi.org/10.1529/biophysj.104.052423 
    ​Details  DOI 
  • 2005 | Journal Article
    ​ ​Detecting protein-induced folding of the U4 snRNA kink-turn by single-molecule multiparameter FRET measurements​
    Nottrott, S.; Woźniak, A. K.; Schröder, G. F.; Kühn-Hölsken, E.; Luhrmann, R. & Grubmüller, H. ​ (2005) 
    RNA, 11(10) pp. 1545​-1554​.​ DOI: https://doi.org/10.1261/rna.2950605 
    ​Details  DOI 
  • 2005 | Journal Article
    ​ ​Insight into the structure and mechanism of the reversible photoswitch of a fl uorescent protein: ​A multi-departmental research approach​
    Andresen, M. ; Wahl, M. C. ; Stiel, A. C. ; Gräter, F. ; Schäfer, L. ; Trowitzsch, S.   & Weber, G.  et al.​ (2005) 
    MPIbpc News, 11(12) pp. 1​-4​.​
    ​Details 
  • 2005 | Journal Article
    ​ ​Simulation of Fluorescence Anisotropy Experiments: Probing Protein Dynamics​
    Schröder, G. F.; Alexiev, U. & Grubmüller, H. ​ (2005) 
    Biophysical Journal, 89(6) pp. 3757​-3770​.​ DOI: https://doi.org/10.1529/biophysj.105.069500 
    ​Details  DOI 
  • 2005 | Book Chapter
    ​ ​Aufbau, Funktion und Diagnostik biogener Moleküle​
    Seeger, S.; Grubmüller, H.  & Tschesche, H.​ (2005)
    In:​Kleinermanns, K.​ (Ed.), Gase, Nanosysteme, Flüssigkeiten pp. 977​-1067. ​Berlin, New York: ​Walter de Gruyter. DOI: https://doi.org/10.1515/9783110198140.977 
    ​Details  DOI 
  • 2005 | Journal Article
    ​ ​Insight into the structure and mechanism of the reversible photoswitch of a fluorescent protein: A multi-departmental research approach​
    Andresen, M. ; Jakobs, S. ; Wahl, M. C. ; Hell, S. W. ; Stiel, A. C. ; Gräter, F.   & Trowitzsch, S.  et al.​ (2005) 
    MPIbpc news, 11(12).​
    ​Details 
  • 2005 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Structure and mechanism of the reversible photoswitch of a fluorescent protein​
    Andresen, M. ; Wahl, M. C. ; Stiel, A. C. ; Gräter, F. ; Schäfer, L. ; Trowitzsch, S.   & Weber, G.  et al.​ (2005) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(37) pp. 13070​-13074​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.0502772102 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Molecular dynamics simulations of protein G challenge NMR-derived correlated backbone motions​
    Lange, O. F.; Grubmüller, H.   & de Groot, B. L. ​ (2005) 
    Angewandte Chemie International Edition, 44(22) pp. 3394​-3399​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/anie.200462957 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Probing conformational disorder in neurotensin by two-dimensional solid-state NMR and comparison to molecular dynamics simulations​
    Heise, H.; Luca, S.; de Groot, B. L. ; Grubmüller, H.   & Baldus, M.​ (2005) 
    Biophysical Journal, 89(3) pp. 2113​-2120​.​ DOI: https://doi.org/10.1529/biophysj.105.059964 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Review
    ​ ​The dynamics and energetics of water permeation and proton exclusion in aquaporins​
    Groot, B. L. de  & Grubmüller, H. ​ (2005)
    Current Opinion in Structural Biology, 15​(2) pp. 176​-183​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.sbi.2005.02.003 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2004 | Journal Article
    ​ ​Cyclopropylidenes, Bicyclopropylidenes, and Vinylcarbenes — Some Modes of Formation and Preparative Applications​
    de Meijere, A.; Schill, H.; Kozhushkov, S. I.; Walsh, R.; Mueller, E. M. & Grubmüller, H. ​ (2004) 
    ChemInform, 35(52).​ DOI: https://doi.org/10.1002/chin.200452259 
    ​Details  DOI 
  • 2004 | Journal Article
    ​ ​Aquaporine: die perfekten Wasserfilter der Zelle​
    Grubmüller, H.   & de Groot, B. L. ​ (2004) 
    Biospektrum: das Magazin für Biowissenschaften, 10(4) pp. 384​-386​.​
    ​Details 
  • 2004 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Cyclopropylidenes, bicyclopropylidenes, and vinylcarbenes - some modes of formation and preparative applications​
    Meijere, A. de ; Schill, H. ; Kozhushkov, S. I. ; Walsh, R.; Müller, E. M. & Grubmüller, H. ​ (2004) 
    Russian Chemical Bulletin, 53(5) pp. 947​-959​.​ DOI: https://doi.org/10.1023/B:RUCB.0000041297.57787.d1 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2004 | Journal Article
    ​ ​Differential Peptide Dynamics Is Linked to Major Histocompatibility Complex Polymorphism​
    Pöhlmann, T.; Böckmann, R. A.; Grubmüller, H. ; Uchanska-Ziegler, B.; Ziegler, A. & Alexiev, U.​ (2004) 
    Journal of Biological Chemistry, 279(27) pp. 28197​-28201​.​ DOI: https://doi.org/10.1074/jbc.c400128200 
    ​Details  DOI 
  • 2004 | Journal Article
    ​ ​Mechanical Properties of Single Motor Molecules Studied by Three-Dimensional Thermal Force Probing in Optical Tweezers​
    Jeney, S.; Stelzer, E. H. K.; Grubmüller, H.   & Florin, E.-L.​ (2004) 
    ChemPhysChem, 5(8) pp. 1150​-1158​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/cphc.200301027 
    ​Details  DOI 
  • 2004 | Journal Article
    ​ ​Multistep Binding of Divalent Cations to Phospholipid Bilayers: A Molecular Dynamics Study​
    Böckmann, R. A. & Grubmüller, H. ​ (2004) 
    Angewandte Chemie International Edition, 43(8) pp. 1021​-1024​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/anie.200352784 
    ​Details  DOI 
  • 2004 | Book Chapter
    ​ ​Proteins as Molecular Machines: Force Probe Simulations​
    Grubmüller, H. ​ (2004)
    In:​Grubmüller, H.; Attig, Norbert; Kremer, Kurt; Binder, Kurt​ (Eds.), Computational Soft Matter: From Synthetic Polymers to Proteins pp. 401​-422. ​Jülich: ​John von Neumann Institute for Computing Jülich.
    ​Details 
  • 2004 | Journal Article
    ​ ​FRETsg: Biomolecular structure model building from multiple FRET experiments​
    Schröder, G. F. & Grubmüller, H. ​ (2004) 
    Computer Physics Communications, 158(3) pp. 10​-157​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2004.02.001 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Journal Article
    ​ ​Mechanical Coupling via the Membrane Fusion SNARE Protein Syntaxin 1A: A Molecular Dynamics Study​
    Knecht, V. & Grubmüller, H. ​ (2003) 
    Biophysical Journal, 84(3) pp. 1527​-1547​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/s0006-3495(03)74965-0 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Journal Article
    ​ ​Maximum likelihood trajectories from single molecule fluorescence resonance energy transfer experiments​
    Schröder, G. F. & Grubmüller, H. ​ (2003) 
    The Journal of Chemical Physics, 119(18) pp. 9920​-9924​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.1616511 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Journal Article
    ​ ​Effect of Sodium Chloride on a Lipid Bilayer​
    Böckmann, R. A.; Hac, A.; Heimburg, T. & Grubmüller, H. ​ (2003) 
    Biophysical Journal, 85(3) pp. 1647​-1655​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/s0006-3495(03)74594-9 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Journal Article
    ​ ​Conformational Dynamics of the F1-ATPase β-Subunit: A Molecular Dynamics Study​
    Böckmann, R. A. & Grubmüller, H. ​ (2003) 
    Biophysical Journal, 85(3) pp. 1482​-1491​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/s0006-3495(03)74581-0 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Journal Article
    ​ ​Conformational dynamics of the F1-ATPase ß-subunit: A molecular dynamics study​
    Böckmann, R. A. & Grubmüller, H. ​ (2003) 
    Biophysical Journal, 85(3) pp. 1482​-1491​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0006-3495(03)74581-0 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Journal Article
    ​ ​Single-molecule fluorescence resonance energy transfer reveals a dynamic equilibrium between closed and open conformations of syntaxin 1​
    Margittai, M.; Widengren, J.; Schweinberger, E.; Schröder, G. F.; Felekyan, S.; Haustein, E. & König, M.  et al.​ (2003) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 100(26) pp. 15516​-15521​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2331232100 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Journal Article
    ​ ​What happens if the room at the bottom runs out? A close look at small water pores​
    Grubmüller, H. ​ (2003) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : PNAS, 100(13) pp. 7421​-7422​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.1533175100 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​The mechanism of proton exclusion in the aquaporin-1 water channel​
    de Groot, B. L. ; Frigato, T.; Helms, V. & Grubmüller, H. ​ (2003) 
    Journal of Molecular Biology, 333(2) pp. 279​-293​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmb.2003.08.003 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2003 | Journal Article
    ​ ​The structure of the aquaporin-1 water channel: A comparison between cryo-electron microscopy and X-ray crystallography​
    de Groot, B. L. ; Engel, A. & Grubmüller, H. ​ (2003) 
    Journal of Molecular Biology, 325(3) pp. 485​-493​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0022-2836(02)01233-0 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Water Permeation through Gramicidin A: Desformylation and the Double Helix: A Molecular Dynamics Study​
    de Groot, B. L. ; Tieleman, D. P.; Pohl, P. & Grubmüller, H. ​ (2002) 
    Biophysical Journal, 82(6) pp. 2934​-2942​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0006-3495(02)75634-8 
    ​Details  DOI 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Mechanik molekularer "Maschinen" am Beispiel des Aquaporins und der F1-ATPase​
    Grubmüller, H. ​ (2002) 
    Jahrbuch der Max-Planck-Gesellschaft., pp. 121​-125​.​
    ​Details 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Force Spectroscopy of Single Biomolecules​
    Rief, M. & Grubmüller, H. ​ (2002) 
    ChemPhysChem, 3(3) pp. 255​-261​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/1439-7641(20020315)3:3<255::aid-cphc255>3.0.co;2-m 
    ​Details  DOI 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Single molecule FRET reveals an equilibrium between a closed and an open conformation of syntaxin 1​
    Widengren, J.; Margittai, M.; Schröder, G. F.; Schweinberger, E.; Felekyan, S.; Haustein, E. & Fasshauer, D. et al.​ (2002) 
    Biophysical Journal, 82(1) pp. 305a​-305a​.​
    ​Details 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Nanoseconds molecular dynamics simulation of primary mechanical energy transfer steps in F1-ATP synthase​
    Böckmann, R. A. & Grubmüller, H. ​ (2002) 
    Nature Structural Biology, 9(3) pp. 198​-202​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nsb760 
    ​Details  DOI 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Membrane fusion​
    Jahn, R.   & Grubmüller, H. ​ (2002) 
    Current Opinion in Cell Biology, 14(4) pp. 488​-495​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/s0955-0674(02)00356-3 
    ​Details  DOI 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Proteine als Filter reinsten Wassers​
    Grubmüller, H.   & de Groot, B. L. ​ (2002) 
    Max Planck Forschung: das Wissenschaftsmagazin der Max-Planck-Gesellschaft, 1 pp. 8​-9​.​
    ​Details 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Aquaporine - Wasserfilter der Zelle​
    Grubmüller, H.   & de Groot, B. L. ​ (2002) 
    Bioforum : Forschung, Entwicklung, Service, 6 pp. 387​-389​.​
    ​Details 
  • 2002 | Journal Article
    ​ ​Predicting unimolecular chemical reactions: Chemical flooding​
    Müller, E. M.; Meijere, A. de   & Grubmüller, H. ​ (2002) 
    The Journal of Chemical Physics, 116(3) pp. 897​-905​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.1427722 
    ​Details  DOI 
  • 2002 | Review
    ​ ​Structure and function of water channels​
    Fujiyoshi, Y.; Mitsuoka, K.; de Groot, B. L. ; Philippsen, A.; Grubmüller, H. ; Agre, P.& Engel, A.​ (2002)
    Current Opinion in Structural Biology, 12​(4) pp. 509​-515​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0959-440X(02)00355-X 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2002 | Review
    ​ ​Progress in the analysis of membrane protein structure and function​
    Werten, P. J. L.; Remigy, H. W.; Groot, B. L. de ; Fotiadis, D.; Philippsen, A.; Stahlberg, H.& Grubmüller, H.  et al.​ (2002)
    FEBS Letters, 529​(1) pp. 65​-72​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0014-5793(02)03290-8 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2001 | Journal Article
    ​ ​A refined structure of human aquaporin-1​
    de Groot, B. ; Engel, A. & Grubmüller, H. ​ (2001) 
    FEBS Letters, 504(3) pp. 206​-211​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0014-5793(01)02743-0 
    ​Details  DOI 
  • 2001 | Thesis | Habilitation
    ​ ​Theorie und Simulation induzierter Konformationsdynamik von Proteinen​
    Grubmüller, H. ​ (2001)
    Göttingen​: Georg-August-Universität Göttingen.
    ​Details 
  • 2001 | Journal Article
    ​ ​Kraftspektroskopie von einzelnen Biomolekülen: Biologische Makromoleküle besser begreifen - mit Einzelmolekül-Kraftmessungen und Computersimulationen​
    Rief, M. & Grubmüller, H. ​ (2001) 
    Physikalische Blätter, 57(2) pp. 55​-61​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/phbl.20010570213 
    ​Details  DOI 
  • 2001 | Journal Article | 
    ​ ​Molecular dynamics force probe simulations of antibody/antigen unbinding: Entropic control and non-additivity of unbinding forces​
    Heymann, B. & Grubmüller, H. ​ (2001) 
    Biophysical Journal, 81(3) pp. 1295​-1313​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0006-3495(01)75787-6 
    ​Details  DOI 
  • 2001 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Water permeation across biological membranes: Mechanism and dynamics of aquaporin-1 and GlpF​
    de Groot, B. L.   & Grubmüller, H. ​ (2001) 
    Science, 294(5550) pp. 2353​-2357​.​ DOI: https://doi.org/10.1126/science.1062459 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2001 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Essential dynamics of reversible peptide folding: Memory-free conformational dynamics governed by internal hydrogen bonds​
    de Groot, B. L. ; Daura, X.; Mark, A. E. & Grubmüller, H. ​ (2001) 
    Journal of Molecular Biology, 309(1) pp. 299​-313​.​ DOI: https://doi.org/10.1006/jmbi.2001.4655 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2000 | Journal Article
    ​ ​Dynamic Force Spectroscopy of Molecular Adhesion Bonds​
    Heymann, B. & Grubmüller, H. ​ (2000) 
    Physical Review Letters, 84(26) pp. 6126​-6129​.​ DOI: https://doi.org/10.1103/physrevlett.84.6126 
    ​Details  DOI 
  • 2000 | Journal Article
    ​ ​Functional Significance of Hierarchical Tiers in Carbonmonoxy Myoglobin: Conformational Substates and Transitions Studied by Conformational Flooding Simulations​
    Schulze, B. G.; Grubmüller, H.   & Evanseck, J. D.​ (2000) 
    Journal of the American Chemical Society, 122(36) pp. 8700​-8711​.​ DOI: https://doi.org/10.1021/ja993788y 
    ​Details  DOI 
  • 2000 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​Exocytosis requires asymmetry in the central layer of the SNARE complex​
    Ossig, R.; Schmitt, H. D.; de Groot, B. L. ; Riedel, D. ; Keränen, S.; Ronne, H. & Grubmüller, H.  et al.​ (2000) 
    EMBO Journal, 19(22) pp. 6000​-6010​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/emboj/19.22.6000 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2000 | Journal Article | Research Paper
    ​ ​The fold of human aquaporin 1​
    de Groot, B. L. ; Heymann, J. B.; Engel, A.; Mitsuoka, K.; Fujiyoshi, Y. & Grubmüller, H. ​ (2000) 
    Journal of Molecular Biology, 300(4) pp. 987​-994​.​ DOI: https://doi.org/10.1006/jmbi.2000.3913 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 1999 | Journal Article
    ​ ​AN02/DNP unbinding forces studied by molecular dynamics AFM simulations​
    Heymann, B. & Grubmüller, H. ​ (1999) 
    Chemical Physics Letters, 303(1-2) pp. 1​-9​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0009-2614(99)00183-9 
    ​Details  DOI 
  • 1999 | Journal Article
    ​ ​AN02/DNP-hapten unbinding forces studied by molecular dynamics atomic force microscopy simulations​
    Heymann, B. & Grubmüller, H. ​ (1999) 
    Chemical Physics Letters, 303(1-2) pp. 1​-9​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/s0009-2614(99)00183-9 
    ​Details  DOI 
  • 1999 | Journal Article
    ​ ​\‘Chair–boat' transitions and side groups affect the stiffness of polysaccharides​
    Heymann, B. & Grubmüller, H. ​ (1999) 
    Chemical Physics Letters, 305(3-4) pp. 202​-208​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/s0009-2614(99)00388-7 
    ​Details  DOI 
  • 1999 | Journal Article
    ​ ​Elastic properties of poly(ethylene-glycol) studied by molecular dynamics stretching simulations​
    Heymann, B. & Grubmüller, H. ​ (1999) 
    Chemical Physics Letters, 307(5-6) pp. 425​-432​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/s0009-2614(99)00531-x 
    ​Details  DOI 
  • 1999 | Book Chapter
    ​ ​How does complexity lead to apparently simple function?​
    Changeux, J.-P.; Moffat, K.; Grubmüller, H. ; Crothers, D. M.; Palma, M. U.; Nienhaus, G. U.& Schulten, K.  et al.​ (1999)
    In:​Deisenhofer, J.; Frauenfelder, H.; Wolynes, P.​ (Eds.), Simplicity and Complexity in Proteins and Nucleic Acids pp. 255​-280. ​Berlin: ​Dahlem University Press.
    ​Details 
  • 1999 | Journal Article
    ​ ​Proteindynamik von Ligand/Rezeptor-Bindungen​
    Grubmüller, H. ​ (1999) 
    MPIbpc News, 1 pp. 1​-4​.​
    ​Details 
  • 1999 | Book Chapter
    ​ ​EGO - An efficient molecular dynamics program and its application to protein dynamics simulations​
    Heller, H.; Eichinger, M.& Grubmüller, H. ​ (1999)
    In:​Esser, Rüdiger; Lewerenz, Marius; Grassberger, Peter; Grotendorst, Johannes​ (Eds.), Workshop on Molecular Dynamics on Parallel Computers pp. 397​-402.  DOI: https://doi.org/10.1142/9789812793768_0010 
    ​Details  DOI 
  • 1998 | Journal Article
    ​ ​Multiple time step algorithms for molecular dynamics simulations of proteins: How good are they?​
    Grubmüller, H.   & Tavan, P.​ (1998) 
    Journal of Computational Chemistry, 19(13) pp. 1534​-1552​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/1096-987x(199810)19:13<1534::aid-jcc10>3.0.co;2-i 
    ​Details  DOI 
  • 1998 | Journal Article
    ​ ​FAMUSAMM: An algorithm for rapid evaluation of electrostatic interactions in molecular dynamics simulations​
    Eichinger, M.; Grubmüller, H. ; Heller, H. & Tavan, P.​ (1998) 
    Journal of Computational Chemistry, 18(14) pp. 1729​-1749​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/(sici)1096-987x(19971115)18:14<1729::aid-jcc3>3.0.co;2-m 
    ​Details  DOI 
  • 1998 | Book Chapter
    ​ ​Conformational dynamics simulations of proteins​
    Eichinger, M.; Heymann, B.; Heller, H.; Grubmüller, H.  & Tavan, P.​ (1998)
    In:​Hermans, J.; Deuflhard, P.; Mark, A. E.; Leimkuhler, B.; Reich, S.; Skeel, R. D.​ (Eds.), Computational Molecular Dynamics: Challenges, Methods, Ideas pp. 78​-97. ​Springer Nature. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-642-58360-5_4 
    ​Details  DOI 
  • 1997 | Book Chapter
    ​ ​Microscopic interpretation of AFM single molecule rupture experiments by molecular dynamics simulations​
    Grubmüller, H.  & Heymann, B.​ (1997)
    In:​Colliex, Christian; Fourmentin-Guilbert, Jean; Engel, Andreas​ (Eds.), Proceedings of the Workshop `STM - AFM - SNOM: New Nanotools for Molecular Biology' pp. 45​-50. ​France: ​Noisy Le Grand.
    ​Details 
  • 1997 | Journal Article
    ​ ​Simulation eines molekularen Erkennungsvorgangs​
    Heymann, B.; Grubmüller, H.   & Tavan, P.​ (1997) 
    Spektrum der Wissenschaft, 3 pp. 14​-16​.​
    ​Details 
  • 1997 | Journal Article
    ​ ​FAMUSAMM: An algorithm for rapid evaluation of electrostatic interaction in molecular dynamics simulations​
    Eichinger, M.; Grubmüller, H. ; Heller, H. & Tavan, P.​ (1997) 
    J Comput Chem., 18(14) pp. 1729​-1749​.​ DOI: https://doi.org/10.1002/(SICI)1096-987X(19971115)18:14<1729::AID-JCC3>3.0.CO;2-M 
    ​Details  DOI 
  • 1996 | Journal Article
    ​ ​Ligand Binding: Molecular Mechanics Calculation of the Streptavidin-Biotin Rupture Force​
    Grubmüller, H. ; Heymann, B. & Tavan, P.​ (1996) 
    Science, 271(5251) pp. 997​-999​.​ DOI: https://doi.org/10.1126/science.271.5251.997 
    ​Details  DOI 
  • 1995 | Journal Article
    ​ ​Predicting slow structural transitions in macromolecular systems: conformational flooding​
    Grubmüller, H. ​ (1995) 
    Physical Review E, 52(3) pp. 2893​-2906​.​ DOI: https://doi.org/10.1103/PhysRevE.52.2893 
    ​Details  DOI 
  • 1995 | Monograph
    ​ ​User Manual for EGO_VIII (Release 2.0)​ ​
    Eichinger, M.; Grubmüller, H.  & Heller, H.​ (1995)
    München​: Leibniz-Rechenzentrum der Bayerischen Akademie der Wissenschaften.
    ​Details 
  • 1994 | Book Chapter
    ​ ​Conformational dynamics of proteins: beyond the nanosecond time scale​
    Grubmüller, H. ; Ehrenhofer, N.& Tavan, P.​ (1994)
    In:​Peyrard, M.​ (Ed.), Nonlinear Excitations in Biomolecules pp. 231​-240. ​Berlin, Heidelberg: ​Springer. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-662-08994-1_17 
    ​Details  DOI 
  • 1994 | Thesis | Doctoral Thesis
    ​ ​Molekulardynamik von Proteinen auf langen Zeitskalen​
    Grubmüller, H. ​ (1994)
    Technische Universität München. 
    München​: Technische Universität München.
    ​Details 
  • 1994 | Journal Article
    ​ ​Molecular dynamics of conformational substates for a simplified protein model​
    Grubmüller, H.   & Tavan, P.​ (1994) 
    The Journal of Chemical Physics, 101(6) pp. 5047​-5057​.​ DOI: https://doi.org/10.1063/1.467427 
    ​Details  DOI 
  • 1993 | Journal Article
    ​ ​BR at work: a computeranimation for the 13-14-cis-model of the photochemical cycle of bacter10rhodopsin​
    Grubmüller, H. ; Döhring, K.; Tavan, P.; Nonella, M. & Oesterhelt, D.​ (1993) 
    Journal of Molecular Graphics, 11(4) pp. 258​-258​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/0263-7855(93)80009-g 
    ​Details  DOI 
  • 1992 | Book Chapter
    ​ ​On the suitability of efficient many-body algorithms for molecular dynamics simulations of biological macromolecules​
    Grubmüller, H. ​ (1992)
    In:​McKinnon, K. I. M.; Plab, F.​ (Eds.), Proceedings of the Second Parallel Numerical Analysis Workshop pp. 226​-238. ​Edinburgh: ​Edinburgh Parallel Computing Centre, University of Edinburgh.
    ​Details 
  • 1991 | Journal Article
    ​ ​Generalized Verlet Algorithm for Efficient Molecular Dynamics Simulations with Long-range Interactions​
    Grubmüller, H. ; Heller, H.; Windemuth, A. & Schulten, K. ​ (1991) 
    Molecular Simulation, 6(1-3) pp. 121​-142​.​ DOI: https://doi.org/10.1080/08927029108022142 
    ​Details  DOI 
  • 1991 | Journal Article
    ​ ​Selbstorganisation von Assoziativspeichern und Musterklassifikatoren: Rekurrente Signalverarbeitung auf topologischen Merkmalskarten​
    Tavan, P. & Grubmüller, H. ​ (1991) 
    Kleinheubacher Berichte, 34 pp. 573​-582​.​
    ​Details 
  • 1990 | Journal Article
    ​ ​Molecular Dynamics Simulation on a Parallel Computer​
    Heller, H.; Grubmüller, H.   & Schulten, K. ​ (1990) 
    Molecular Simulation, 5(3-4) pp. 133​-165​.​ DOI: https://doi.org/10.1080/08927029008022127 
    ​Details  DOI 
  • 1990 | Journal Article
    ​ ​Self-organization of associative memory and pattern classification: recurrent signal processing on topological feature maps​
    Tavan, P.; Grubmüller, H.   & Kühnel, H.​ (1990) 
    Biological Cybernetics, 64(2) pp. 95​-105​.​ DOI: https://doi.org/10.1007/bf02331338 
    ​Details  DOI 
  • 1990 | Book Chapter
    ​ ​Molecular dynamics simulations on a systolic ring of transputers​
    Heller, H.; Boehncke, K.; Grubmüller, H.  & Schulten, K. ​ (1990)
    In:​Wagner, Alan S.​ (Ed.), Transputer research and applications pp. 83​-94. ​Van Diemenstraat 94, 1013 CN Amsterdam, The Netherlands: ​North American Transputer Users Group, IOS Press.
    ​Details 
  • 1989 | Thesis | Diploma Thesis
    ​ ​Dynamiksimulation sehr großer Makromoleküle auf einem Parallelrechner​
    Grubmüller, H. ​ (1989)
    München​: Technische Universität München.
    ​Details 
  • 1988 | Journal Article
    ​ ​Eine CRAY für 'jedermann'​
    Heller, H.; Grubmüller, H.   & Schulten, K. ​ (1988) 
    MC: Die Microcomputer-Zeitschrift, 11 pp. 48​-65​.​
    ​Details 

Publication List

All Articles (Book & Journal) Conference objects Books Books & Book chapters Book chapters & Review Articles & Preprints Papers (Journal & Conference)

Type

Subtype

Date issued

Author

Project

Peer-Reviewed

Organization

Language

Fulltext

Options

Citation Style

GRO View APA Chicago MLA Vancouver
https://publications.goettingen-research-online.de URI: /cris/rp/rp00003
ID: 0000000
PREF: default TOKEN:

0

Sort

Issue Date
ASC DESC
Title
ASC DESC

Embed

JavaScript
Link

Export

Activate Export Mode
Deactivate Export Mode

Select some or all items (max. 800 for CSV/Excel) from the publications list, then choose an export format below.