Infrastruktur zur Etablierung genomisch unterstützter Routine​verfahren für die deutsche Pferdezucht

2022 | journal article; research paper. A publication with affiliation to the University of Göttingen.

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​Infrastruktur zur Etablierung genomisch unterstützter Routine​verfahren für die deutsche Pferdezucht​
Stock, K. F.; Wobbe, M.; Haeusler, M.; Alkhoder, H.; Nolte, W.; Kuehn, C. & Vosgerau, S. et al.​ (2022) 
Züchtungskunde94(5) pp. 321​-329​.​

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Title Variant(s)
Infrastructure for routine implementation of genomically enhanced applications for horse breeding in Germany
Authors
Stock, Kathrin F.; Wobbe, Mirell; Haeusler, Melanie; Alkhoder, Hatem; Nolte, Wietje; Kuehn, Christa; Vosgerau, Sarah; Krattenmacher, Nina; Von Depka Prondzinski, Mario; Tetens, Jens; Thaller, Georg; Kalm, Ernst; Reents, Reinhard
Abstract
Das Bestreben der Pferdezucht, genomisch unterstützte Anwendungen als Routineverfahren zu etablieren und so das Potenzial der Genomik zur nachhaltigen Stärkung der Zuchtprogramme zu erschließen, bedeutet wachsende Anforderungen an die Infrastruktur. Eine Schlüsselstellung nehmen hierbei die Laboranalyse von genomweiten Markern, sogenannten Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), und die damit zusammenhängende Logistik ein, deren Leistungsfähigkeit und Zuverlässigkeit es unter Berücksichtigung der verschiedenen Nutzungsprofile zu optimieren gilt. Im Verbund von Praxis und Wissenschaft wurden seit 2017 wichtige Grundlagen erarbeitet, um Prototypen für genomisch unterstützte Verfahren bereitstellen und schließlich zur Praxisreife führen zu können. Die Abstammungsüberprüfung war die erste SNP-gestützte Routineanwendung für die deutsche Pferdezucht. Bevor diese 2021 eingeführt werden konnte, waren umfangreiche Arbeiten erforderlich, um in einem geschlossenen System vom Stellen eines Unter​suchungsantrages bis zur Arbeit mit Auswertungsergebnissen alle Schritte digital absichern und unterstützen zu können. Die Pferdegenomdatenbank ermöglicht die Speicherung und Verwaltung über verschiedene Systeme generierter SNP-Genotypdaten und gewähr​leistet, dass diese effizient gemeinsam in Analysen eingehen. Genomische Services bezeichnen das neue, künftig wachsende Angebot an Beauftragungsmöglichkeiten für Labor- und SNP-Datenanalytik, das Zuchtverbänden und ihren Mitgliedern digital bereitgestellt wird, um in der Praxis Mehrwert durch den Einsatz der Genomik beim Pferd zu erzielen.
Issue Date
2022
Journal
Züchtungskunde 
Organization
Department für Nutztierwissenschaften 
Language
German
Fulltext
https://www.zuechtungskunde.de/Archiv/Infrastruktur-zur-Etablierung-genomisch-unterstuetzter-Routinex200Bverfahren-fuer-die-deutsche-Pferdezucht,QUlEPTcyMzMwMTEmTUlEPTY5MTU4.html?UID=CB27D3D71CF97FE24A116482381DF2F5A101

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Citations