Prof. Dr. Burkhard Morgenstern

Name Card

Main Affiliation
 
Staff Status
unigoe
 

1-82 von 82
 
Die bibliographischen Daten in Ihrer Publikationsliste sind vollständig.
Sie können vorhandene Daten in den blau unterlegten Feldern korrigieren. Bitte klicken Sie dazu jeweils das farbig markierte Feld an. Das Löschen von Daten ist hier nicht möglich.
Felder, die nicht farbig markiert sind (z. B. die Autorinnen und Autoren), können über das Eingabeformular bearbeitet werden. Klicken Sie dazu auf vor der jeweiligen Publikation.
Die bibliographischen Daten in Ihrer Publikationsliste sind möglicherweise unvollständig. Sie können
  • evtl. fehlende Daten in den rot markierten Feldern nachtragen oder
  • vorhandene Daten in den blau unterlegten Feldern korrigieren.
Bitte klicken Sie dazu jeweils das farbig markierte Feld an. Das Löschen von Daten ist hier nicht möglich.
Felder, die nicht farbig markiert sind (z. B. die Autorinnen und Autoren), können über das Eingabeformular bearbeitet werden. Klicken Sie dazu auf vor der jeweiligen Publikation.
Check/Uncheck all
  • 2022 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Insertions and deletions as phylogenetic signal in an alignment-free context​
    Birth, N.; Dencker, T. & Morgenstern, B. ​ (2022) 
    PLOS Computational Biology, 18(8) pp. e1010303​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1010303 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Genome and Methylome analysis of a phylogenetic novel Campylobacter coli cluster with C. jejuni introgression​
    Dieckmann, A.-L.; Riedel, T.; Bunk, B.; Spröer, C.; Overmann, J.; Groß, U. & Bader, O. u.a.​ (2021) 
    Microbial Genomics, 7(10).​ DOI: https://doi.org/10.1099/mgen.0.000679 
    ​Details  DOI 
  • 2021 | Zeitschriftenartikel | Research Paper | 
    ​ ​A 20‐kb lineage‐specific genomic region tames virulence in pathogenic amphidiploid Verticillium longisporum​
    Harting, R.; Starke, J.; Kusch, H. ; Pöggeler, S.; Maurus, I.; Schlüter, R. & Landesfeind, M. u.a.​ (2021) 
    Molecular Plant Pathology,.​ DOI: https://doi.org/10.1111/mpp.13071 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Preprint
    ​ ​V. longisporum elicits media-dependent secretome responses with a further capacity to distinguish between plant-related environments​
    Leonard, M.; Kühn, A.; Harting, R.; Maurus, I.; Nagel, A.; Starke, J.& Kusch, H.  u.a.​ (2020). DOI: https://doi.org/10.1101/2020.02.11.943803 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Smash++: an alignment-free and memory-efficient tool to find genomic rearrangements​
    Hosseini, M.; Pratas, D.; Morgenstern, B.   & Pinho, A. J​ (2020) 
    GigaScience, 9(5).​ DOI: https://doi.org/10.1093/gigascience/giaa048 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Verticillium longisporum Elicits Media-Dependent Secretome Responses With Capacity to Distinguish Between Plant-Related Environments​
    Leonard, M.; Kühn, A.; Harting, R.; Maurus, I.; Nagel, A.; Starke, J. & Kusch, H.  u.a.​ (2020) 
    Frontiers in Microbiology, 11.​ DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01876 
    ​Details  DOI 
  • 2020 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​The number of k-mer matches between two DNA sequences as a function of k and applications to estimate phylogenetic distances​
    Röhling, S.; Linne, A.; Schellhorn, J. ; Hosseini, M.; Dencker, T. & Morgenstern, B. ​ (2020) 
    PLoS One, 15(2) pp. e0228070​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0228070 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Benchmarking of alignment-free sequence comparison methods​
    Zielezinski, A.; Girgis, H. Z.; Bernard, G.; Leimeister, C.-A.; Tang, K.; Dencker, T. & Lau, A. K. u.a.​ (2019) 
    Genome Biology, 20(1).​ DOI: https://doi.org/10.1186/s13059-019-1755-7 
    ​Details  DOI 
  • 2019 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Read-SpaM: assembly-free and alignment-free comparison of bacterial genomes with low sequencing coverage​
    Lau, A.-K.; Dörrer, S.; Leimeister, C.-A.; Bleidorn, C.   & Morgenstern, B. ​ (2019) 
    BMC Bioinformatics, 20(Suppl 20) art. 638​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s12859-019-3205-7 
    ​Details  DOI  PMID  PMC 
  • 2018 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Accurate multiple alignment of distantly related genome sequences using filtered spaced word matches as anchor points​
    Leimeister, C.-A.; Dencker, T. & Morgenstern, B. ​ (2018) 
    Bioinformatics, 35(2) pp. 211​-218​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty592 
    ​Details  DOI 
  • 2018 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Prot-SpaM: fast alignment-free phylogeny reconstruction based on whole-proteome sequences​
    Leimeister, C.-A.; Schellhorn, J. ; Dörrer, S.; Gerth, M.; Bleidorn, C.   & Morgenstern, B. ​ (2018) 
    GigaScience, 8(3).​ DOI: https://doi.org/10.1093/gigascience/giy148 
    ​Details  DOI 
  • 2017 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Phylogeny reconstruction based on the length distribution of k-mismatch common substrings​
    Morgenstern, B. ; Schöbel, S. & Leimeister, C.-A.​ (2017) 
    Algorithms for Molecular Biology, 12(1) art. 27​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s13015-017-0118-8 
    ​Details  DOI 
  • 2017 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Fast and accurate phylogeny reconstruction using filtered spaced-word matches​
    Leimeister, C.-A.; Sohrabi-Jahromi, S. & Morgenstern, B. ​ (2017) 
    Bioinformatics, 33(7) pp. 971​-979​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw776 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2016 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​rasbhari: Optimizing Spaced Seeds for Database Searching, Read Mapping and Alignment-Free Sequence Comparison​
    Hahn, L.; Leimeister, C.-A.; Ounit, R.; Lonardi, S. & Morgenstern, B. ​ (2016) 
    PLoS Computational Biology, 12(10) art. e1005107​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005107 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​MarVis-Pathway: integrative and exploratory pathway analysis of non-targeted metabolomics data​
    Kaever, A.; Landesfeind, M.; Feussner, K.; Mosblech, A.; Heilmann, I.; Morgenstern, B.   & Feussner, I. u.a.​ (2015) 
    Metabolomics, 11(3) pp. 764​-777​.​ DOI: https://doi.org/10.1007/s11306-014-0734-y 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2015 | Zeitschriftenartikel | Research Paper | 
    ​ ​The iBeetle large-scale RNAi screen reveals gene functions for insect development and physiology​
    Schmitt-Engel, C.; Schultheis, D.; Schwirz, J.; Stroehlein, N.; Troelenberg, N.; Majumdar, U. & Dao, V. A. u.a.​ (2015) 
    Nature Communications, 6 art. 7822​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/ncomms8822 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2015 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Estimating evolutionary distances between genomic sequences from spaced-word matches​
    Morgenstern, B. ; Zhu, B.; Horwege, S. & Leimeister, C. A.​ (2015) 
    Algorithms for Molecular Biology, 10 art. x​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s13015-015-0032-x 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2014 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​kmacs: the k-mismatch average common substring approach to alignment-free sequence comparison​
    Leimeister, C.-A. & Morgenstern, B. ​ (2014) 
    Bioinformatics, 30(14) pp. 2000​-2008​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu331 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2014 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Spaced words and kmacs: fast alignment-free sequence comparison based on inexact word matches​
    Horwege, S.; Lindner, S.; Boden, M.; Hatje, K.; Kollmar, M.; Leimeister, C.-A. & Morgenstern, B. ​ (2014) 
    Nucleic Acids Research, 42(W1) pp. W7​-W11​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gku398 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2014 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Meta-Analysis of Pathway Enrichment: Combining Independent and Dependent Omics Data Sets​
    Kaever, A.; Landesfeind, M.; Feussner, K.; Morgenstern, B. ; Feussner, I. & Meinicke, P. ​ (2014) 
    PLoS ONE, 9(2) art. e89297​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0089297 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2014 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Fast alignment-free sequence comparison using spaced-word frequencies​
    Leimeister, C.-A.; Boden, M.; Horwege, S.; Lindner, S. & Morgenstern, B. ​ (2014) 
    Bioinformatics, 30(14) pp. 1991​-1999​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu177 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2013 | Tagungsband
    ​ ​German Conference on Bioinformatics 2013​
    Beißbarth, T. ; Kollmar, M. ; Leha, A. ; Morgenstern, B. ; Schultz, A.-K.; Waack, S.  & Wingender, E. ​ (Eds.) (2013)
    German Conference on Bioinformatics 2013​, Göttingen.
    ​Details 
  • 2013 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​DIALIGN at GOBICS-multiple sequence alignment using various sources of external information​
    Al Ait, L.; Yamak, Z. & Morgenstern, B. ​ (2013) 
    Nucleic Acids Research, 41(W1) pp. W3​-W7​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkt283 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2012 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​jpHMM: recombination analysis in viruses with circular genomes such as the hepatitis B virus​
    Schultz, A.-K.; Bulla, I.; Abdou-Chekaraou, M.; Gordien, E.; Morgenstern, B. ; Zoulim, F. & Deny, P. u.a.​ (2012) 
    Nucleic Acids Research, 40(W1) pp. W193​-W198​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gks414 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2011 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​5 ' TRU: Identification and Analysis of Translationally Regulative 5 ' Untranslated Regions in Amino Acid Starved Yeast Cells​
    Rachfall, N.; Heinemeyer, I.; Morgenstern, B. ; Valerius, O. & Braus, G. H.​ (2011) 
    Molecular & Cellular Proteomics, 10(6).​ DOI: https://doi.org/10.1074/mcp.M110.003350 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2011 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Identification of Novel Plant Peroxisomal Targeting Signals by a Combination of Machine Learning Methods and in Vivo Subcellular Targeting Analyses​
    Lingner, T.; Kataya, A. R.; Antonicelli, G. E.; Benichou, A.; Nilssen, K.; Chen, X.-Y. & Siemsen, T. u.a.​ (2011) 
    The Plant Cell, 23(4) pp. 1556​-1572​.​ DOI: https://doi.org/10.1105/tpc.111.084095 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2011 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​MolabIS - An integrated information system for storing and managing molecular genetics data​
    Truong, C. V. C.; Groeneveld, L. F.; Morgenstern, B.   & Groeneveld, E.​ (2011) 
    BMC Bioinformatics, 12 art. 425​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-12-425 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2011 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Detection of viral sequence fragments of HIV-1 subfamilies yet unknown​
    Unterthiner, T.; Schultz, A.-K.; Bulla, J.; Morgenstern, B. ; Stanke, M. & Bulla, I.​ (2011) 
    BMC Bioinformatics, 12 art. 93​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-12-93 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2010 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​jpHMM: improving the reliability of recombination prediction in HIV-1​
    Schultz, A.-K.; Zhang, M.; Bulla, I.; Leitner, T.; Korber, B.; Morgenstern, B.   & Stanke, M.​ (2010) 
    Nucleic Acids Research, 38(3) pp. 1059​-1059​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkq015 
    ​Details  DOI 
  • 2010 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​The role of recombination in the emergence of a complex and dynamic HIV epidemic​
    Zhang, M.; Foley, B.; Schultz, A.-K.; Macke, J. P.; Bulla, I.; Stanke, M. & Morgenstern, B.  u.a.​ (2010) 
    Retrovirology, 7(25)-15​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1742-4690-7-25 
    ​Details  DOI 
  • 2010 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​HIV classification using the coalescent theory​
    Bulla, I.; Schultz, A.-K.; Schreiber, F.; Zhang, M.; Leitner, T.; Korber, B. & Morgenstern, B.  u.a.​ (2010) 
    Bioinformatics, 26(11) pp. 1409​-1415​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq159 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2010 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​A min-cut algorithm for the consistency problem in multiple sequence alignment​
    Corel, E.; Pitschi, F. & Morgenstern, B. ​ (2010) 
    Bioinformatics, 26(8) pp. 1015​-1021​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq082 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2010 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​DIALIGN-TX and multiple protein alignment using secondary structure information at GOBICS​
    Subramanian, A. R.; Hiran, S.; Steinkamp, R.; Meinicke, P. ; Corel, E. & Morgenstern, B. ​ (2010) 
    Nucleic Acids Research, 38 pp. W19​-W22​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkq442 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2010 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Improved Phylogenomic Taxon Sampling Noticeably Affects Nonbilaterian Relationships​
    Pick, K.; Philippe, H.; Schreiber, F.; Erpenbeck, D.; Jackson, D. J. ; Wrede, P. & Wiens, M. u.a.​ (2010) 
    Molecular Biology and Evolution, 27(9) pp. 1983​-1987​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/molbev/msq089 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2009 | Zeitschriftenartikel | Research Paper
    ​ ​AUGUSTUS at MediGRID: Adaption of a bioinformatics application to grid computing for efficient genome analysis​
    Sommerfeld, D.; Lingner, T.; Stanke, M.; Morgenstern, B.   & Richter, H.​ (2009) 
    Future Generation Computer Systems, 25(3) pp. 337​-345​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.future.2008.05.010 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2009 | Konferenzbeitrag (Abstract)
    ​ ​Identification of metabolic changes after wounding in Arabidopsis thaliana by an unbiased UPLC-MS approach​
    Goebel, C.; Feussner, K.; Kaever, A.; Meinicke, P. ; Morgenstern, B.   & Feussner, I.​ (2009)
    Chemistry and Physics of Lipids, 160 ​50th International Conference on Bioscience of Lipids​, Regenburg, GERMANY.
    Clare​: Elsevier Ireland Ltd. DOI: https://doi.org/10.1016/j.chemphyslip.2009.06.024 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2009 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​OrthoSelect: a web server for selecting orthologous gene alignments from EST sequences​
    Schreiber, F.; Woerheide, G. & Morgenstern, B. ​ (2009) 
    Nucleic Acids Research, 37 pp. W185​-W188​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkp434 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2009 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​jpHMM: Improving the reliability of recombination prediction in HIV-1​
    Schultz, A.-K.; Zhang, M.; Bulla, I.; Leitner, T.; Korber, B.; Morgenstern, B.   & Stanke, M.​ (2009) 
    Nucleic Acids Research, 37 pp. W647​-W651​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkp371 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2009 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Phylogenomics Revives Traditional Views on Deep Animal Relationships​
    Philippe, H.; Derelle, R.; Lopez, P.; Pick, K.; Borchiellini, C.; Boury-Esnault, N. & Vacelet, J. u.a.​ (2009) 
    Current Biology, 19(8) pp. 706​-712​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.cub.2009.02.052 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2009 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Rhizobium sp Strain NGR234 Possesses a Remarkable Number of Secretion Systems​
    Schmeisser, C.; Liesegang, H. ; Krysciak, D.; Bakkou, N.; Le Quere, A.; Wollherr, A. & Heinemeyer, I. u.a.​ (2009) 
    Applied and Environmental Microbiology, 75(12) pp. 4035​-4045​.​ DOI: https://doi.org/10.1128/AEM.00515-09 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2009 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​OrthoSelect: a protocol for selecting orthologous groups in phylogenomics​
    Schreiber, F.; Pick, K. ; Erpenbeck, D.; Woerheide, G.   & Morgenstern, B. ​ (2009) 
    BMC Bioinformatics, 10 art. 219​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-10-219 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​DIALIGN-TX: greedy and progressive approaches for segment-based multiple sequence alignment​
    Subramanian, A. R.; Kaufmann, M. & Morgenstern, B. ​ (2008) 
    Algorithms for molecular biology, 3(6) pp. 1​-11​.​
    ​Details 
  • 2008 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Improved coverage of cDNA-AFLP by sequential digestion of immobilized cDNA​
    Weiberg, A.; Poehler, D.; Morgenstern, B.   & Karlovsky, P. ​ (2008) 
    BMC Genomics, 9 art. 480​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-480 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Metabolite-based clustering and visualization of mass spectrometry data using one-dimensional self-organizing maps​
    Meinicke, P. ; Lingner, T.; Kaever, A.; Feussner, K.; Goebel, C.; Feussner, I. & Karlovsky, P.  u.a.​ (2008) 
    Algorithms for Molecular Biology, 3 art. 9​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1748-7188-3-9 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Stability of multiple alignments and phylogenetic trees: an analysis of ABC-transporter proteins family​
    Wagner, H.; Morgenstern, B.   & Dress, A.​ (2008) 
    Algorithms for Molecular Biology, 3 art. 15​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1748-7188-3-15 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2008 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Gene prediction in metagenomic fragments: A large scale machine learning approach​
    Hoff, K. J.; Tech, M. ; Lingner, T.; Daniel, R.; Morgenstern, B.   & Meinicke, P. ​ (2008) 
    BMC Bioinformatics, 9 art. 217​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-9-217 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2007 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Comparative analysis of the complete genome sequence of the plant growth-promoting bacterium Bacillus amyloliquefaciens FZB42​
    Chen, X. H.; Koumoutsi, A.; Scholz, R.; Eisenreich, A.; Schneider, K.; Heinemeyer, I. & Morgenstern, B.  u.a.​ (2007) 
    Nature Biotechnology, 25(9) pp. 1007​-1014​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/nbt1325 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​AUGUSTUS at EGASP: using EST, protein and genomic alignments for improved gene prediction in the human genome​
    Stanke, M.; Tzvetkova, A. & Morgenstern, B. ​ (2006) 
    Genome Biology, 7 art. S11​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/gb-2006-7-s1-s11 
    ​Details  DOI  WoS 
  • 2006 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​AUGUSTUS: ab initio prediction of alternative transcripts​
    Stanke, M.; Keller, O.; Gunduz, I.; Hayes, A.; Waack, S. & Morgenstern, B. ​ (2006) 
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 34 pp. W435​-W439​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkl200 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​jpHMM at GOBICS: a web server to detect genomic recombinations in HIV-1​
    Zhang, M.; Schultz, A.-K.; Calef, C.; Kuiken, C.; Leitner, T.; Korber, B. & Morgenstern, B.  u.a.​ (2006) 
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 34 pp. W463​-W465​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkl255 
    ​Details  DOI 
  • 2006 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Multiple sequence alignment with user-defined anchor points​
    Morgenstern, B. ; Prohaska, S. J.; Poehler, D. & Stadler, P. F.​ (2006) 
    Algorithms for Molecular Biology, 1 art. 6​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1748-7188-1-6 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​A jumping profile Hidden Markov Model and applications to recombination sites in HIV and HCV genomes​
    Schultz, A.-K.; Zhang, M.; Leitner, T.; Kuiken, C.; Korber, B.; Morgenstern, B.   & Stanke, M.​ (2006) 
    BMC Bioinformatics, 7 art. 265​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-265 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Gene prediction in eukaryotes with a generalized hidden Markov model that uses hints from external sources​
    Stanke, M.; Schoffmann, O.; Morgenstern, B.   & Waack, S.​ (2006) 
    BMC Bioinformatics, 7 art. 62​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-62 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​TICO: a tool for postprocessing the predictions of prokaryotic translation initiation sites​
    Tech, M. ; Morgenstern, B.   & Meinicke, P. ​ (2006) 
    Nucleic Acids Research, 34 pp. W588​-W590​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkl313 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2006 | Zeitschriftenartikel | Letter Note | 
    ​ ​New journal: Algorithms for molecular biology​
    Morgenstern, B.   & Stadler, P. F.​ (2006) 
    Algorithms for Molecular Biology, 1 art. 1​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1748-7188-1-1 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​TICO: a tool for improving predictions of prokaryotic translation initiation sites​
    Tech, M. ; Pfeifer, N.; Morgenstern, B.   & Meinicke, P. ​ (2005) 
    Bioinformatics, 21(17) pp. 3568​-3569​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti563 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Multiple alignment of genomic sequences using CHAOS, DIALIGN and ABC​
    Pohler, D.; Werner, N.; Steinkamp, R. & Morgenstern, B. ​ (2005) 
    Nucleic Acids Research, 33 pp. W532​-W534​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gki386 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​AUGUSTUS: a web server for gene prediction in eukaryotes that allows user-defined constraints​
    Stanke, M. & Morgenstern, B. ​ (2005) 
    Nucleic Acids Research, 33 pp. W465​-W467​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gki458 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​DIALIGN-T: An improved algorithm for segment-based multiple sequence alignment​
    Subramanian, A. R.; Weyer-Menkhoff, J.; Kaufmann, M. & Morgenstern, B. ​ (2005) 
    BMC Bioinformatics, 6 art. 66​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-6-66 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2005 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Multiple sequence alignment with user-defined constraints at GOBICS​
    Morgenstern, B. ; Werner, N.; Prohaska, S. J.; Steinkamp, R.; Schneider, I.; Subramanian, A. R. & Stadler, P. F. u.a.​ (2005) 
    Bioinformatics, 21(7) pp. 1271​-1273​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti142 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2004 | Konferenzbeitrag (Abstract)
    ​ ​The DIALIGN multiple alignment program: Recent developments and applications​
    Morgenstern, B. ​ (2004)
    CLADISTICS-THE INTERNATIONAL JOURNAL OF THE WILLI HENNIG SOCIETY, 20(1) pp. 89​-90. ​22nd Annual Meeting of the Willi-Hennig-Society​, New York Botan Garden, Bronx, NY.
    London​: Academic Press Ltd Elsevier Science Ltd.
    ​Details  WoS 
  • 2004 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​The CHAOS/DIALIGN WWW server for multiple alignment of genomic sequences​
    Brudno, M.; Steinkamp, R. & Morgenstern, B. ​ (2004) 
    Nucleic Acids Research, 32 pp. W41​-W44​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkh361 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2004 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​DIALIGN: multiple DNA and protein sequence alignment at BiBiServ​
    Morgenstern, B. ​ (2004) 
    Nucleic Acids Research, 32 pp. W33​-W36​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkh373 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2004 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​DIALIGN P: Fast pair-wise and multiple sequence alignment using parallel processors​
    Schmollinger, M.; Nieselt, K.; Kaufmann, M. & Morgenstern, B. ​ (2004) 
    BMC Bioinformatics, 5 art. 128​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-5-128 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2004 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​AUGUSTUS: a web server for gene finding in eukaryotes​
    Stanke, M.; Steinkamp, R.; Waack, S. & Morgenstern, B. ​ (2004) 
    Nucleic Acids Research, 32 pp. W309​-W312​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkh379 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2004 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​AGenDA: gene prediction by cross-species sequence comparison​
    Taher, L.; Rinner, O.; Garg, S.; Sczyrba, A. & Morgenstern, B. ​ (2004) 
    Nucleic Acids Research, 32 pp. W305​-W308​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkh386 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2004 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Oligo kernels for datamining on biological sequences: a case study on prokaryotic translation initiation sites​
    Meinicke, P. ; Tech, M. ; Morgenstern, B.   & Merkl, R.​ (2004) 
    BMC Bioinformatics, 5 art. 169​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-5-169 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2003 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​AltAVisT: Comparing alternative multiple sequence alignments​
    Morgenstern, B. ; Goel, S.; Sczyrba, A. & Dress, A.​ (2003) 
    Bioinformatics, 19(3) pp. 425​-426​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btf882 
    ​Details  DOI 
  • 2003 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​AGenDA: homology-based gene prediction​
    Taher, L.; Rinner, O.; Garg, S.; Sczyrba, A.; Brudno, M.; Batzoglou, S. & Morgenstern, B. ​ (2003) 
    Bioinformatics, 19(12) pp. 1575​-1577​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg181 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2003 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​Fast and sensitive multiple alignment of large genomic sequences​
    Brudno, M.; Chapman, M. A.; Gottgens, B.; Batzoglou, S. & Morgenstern, B. ​ (2003) 
    BMC Bioinformatics, 4 art. 66​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-4-66 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2003 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Divide-and-conquer multiple alignment with segment-based constraints​
    Sammeth, M.; Morgenstern, B.   & Stoye, J.​ (2003) 
    Bioinformatics, 19 pp. II189​-II195​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg1077 
    ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 
  • 2002 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Exon discovery by genomic sequence alignment​
    Morgenstern, B. ; Rinner, O.; Abdeddaim, S.; Haase, D.; Mayer, K. F. X.; Dress, A. W. M. & Mewes, H.-W.​ (2002) 
    Bioinformatics, 18(6) pp. 777​-787​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.6.777 
    ​Details  DOI 
  • 2002 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​A simple and space-efficient fragment-chaining algorithm for alignment of DNA and protein sequences​
    Morgenstern, B. ​ (2002) 
    Applied Mathematics Letters, 15(1) pp. 11​-16​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0893-9659(01)00085-4 
    ​Details  DOI 
  • 2002 | Zeitschriftenartikel | 
    ​ ​MIPS: a database for genomes and protein sequences.​
    Mewes, H. W.; Frishman, D.; Güldener, U.; Mannhaupt, G.; Mayer, K.; Mokrejs, M. & Morgenstern, B.  u.a.​ (2002) 
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 30(1) pp. 31​-34​.​
    ​Details 
  • 2001 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​The HIB database of annotated UniGene clusters​
    Geier, B.; Kastenmuller, G.; Fellenberg, M.; Mewes, H.-W. & Morgenstern, B. ​ (2001) 
    Bioinformatics, 17(6) pp. 571​-572​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/17.6.571 
    ​Details  DOI 
  • 2000 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​A space-efficient algorithm for aligning large genomic sequences​
    Morgenstern, B. ​ (2000) 
    Bioinformatics, 16(10) pp. 948​-949​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/16.10.948 
    ​Details  DOI 
  • 1999 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​An exact solution for the segment-to-segment multiple sequence alignment problem​
    Lenhof, H.; Morgenstern, B.   & Reinert, K.​ (1999) 
    Bioinformatics, 15(3) pp. 203​-210​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/15.3.203 
    ​Details  DOI 
  • 1999 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Evolution of bHLH transcription factors: modular evolution by domain shuffling?​
    Morgenstern, B.   & Atchley, W. R.​ (1999) 
    Molecular Biology and Evolution, 16(12) pp. 1654​-1663​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026079 
    ​Details  DOI 
  • 1999 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​DIALIGN 2: improvement of the segment-to-segment approach to multiple sequence alignment​
    Morgenstern, B. ​ (1999) 
    Bioinformatics, 15(3) pp. 211​-218​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/15.3.211 
    ​Details  DOI 
  • 1998 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​The number of standard and of effective multiple alignments​
    Dress, A.; Morgenstern, B.   & Stoye, J.​ (1998) 
    Applied Mathematics Letters, 11(4) pp. 43​-49​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/S0893-9659(98)00054-8 
    ​Details  DOI 
  • 1998 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​DIALIGN: finding local similarities by multiple sequence alignment​
    Morgenstern, B. ; Frech, K.; Dress, A. & Werner, T.​ (1998) 
    Bioinformatics, 14(3) pp. 290​-294​.​ DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/14.3.290 
    ​Details  DOI 
  • 1996 | Zeitschriftenartikel
    ​ ​Multiple DNA and protein sequence alignment based on segment-to-segment comparison.​
    Morgenstern, B. ; Dress, A. & Werner, T.​ (1996) 
    Proceedings of the National Academy of Sciences, 93(22) pp. 12098​-12103​.​ DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.93.22.12098 
    ​Details  DOI 

Publikationsliste

Alle Artikel (Buch & Zeitschrift) Konferenzveröffentlichungen Artikel & Preprints Papers (Zeitschrift & Konferenz)

Filter

Aktive Filter:
Person:  Morgenstern, B.

Typ

Untertyp

Erscheinungsdatum

Autorin/Autor

Begutachtet

Organisation

Sprache

Volltext

Optionen

Zitationsstil

GRO Ansicht APA Chicago MLA Vancouver
https://publications.goettingen-research-online.de URI: /cris/rp/rp34532
ID: 0000000
PREF: default TOKEN:

0

Sortieren nach

Erscheinungsdatum
AUF AB
Titel
AUF AB

Einbinden

JavaScript
Link

Export

Export Modus aktivieren
Export Modus deaktivieren

Wählen Sie einzelne oder alle Elemente aus der Publikationsliste aus (max. 800 Einträge bei Excel/CSV) und wählen Sie im Anschluss ein Exportformat aus.